More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0410 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  100 
 
 
305 aa  620  1e-177  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_353  ABC-2 type transport system, ATP-binding protein  93.44 
 
 
305 aa  549  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.761814  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  91.8 
 
 
305 aa  549  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  45.4 
 
 
312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  43.14 
 
 
305 aa  257  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  43.28 
 
 
315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  43.95 
 
 
312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  43.09 
 
 
311 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  41.75 
 
 
310 aa  249  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  43.23 
 
 
310 aa  248  8e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  41.42 
 
 
310 aa  247  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  41.75 
 
 
293 aa  248  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  43.14 
 
 
307 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  42.62 
 
 
311 aa  246  4e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  41.51 
 
 
311 aa  245  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  43.05 
 
 
323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  40.39 
 
 
306 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  41.12 
 
 
305 aa  242  7e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  41.39 
 
 
345 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  39.8 
 
 
322 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  42.57 
 
 
310 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  41.04 
 
 
321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  40.66 
 
 
326 aa  239  5.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  41.42 
 
 
309 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  41.42 
 
 
309 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  41.39 
 
 
304 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  44.33 
 
 
317 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  41.06 
 
 
304 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  41.25 
 
 
344 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  41.06 
 
 
304 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  41.06 
 
 
304 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  42.07 
 
 
303 aa  232  6e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  39.46 
 
 
302 aa  231  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  40 
 
 
339 aa  231  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  41.06 
 
 
304 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  40.65 
 
 
351 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  41.06 
 
 
326 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  40.65 
 
 
351 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  40.65 
 
 
304 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  40.65 
 
 
304 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  40.65 
 
 
306 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  40.39 
 
 
320 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  40.72 
 
 
320 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  40.65 
 
 
304 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  40.65 
 
 
304 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  43.05 
 
 
301 aa  229  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  40.13 
 
 
355 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  40.07 
 
 
320 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  40.13 
 
 
373 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  40.86 
 
 
314 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  39.4 
 
 
342 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  40.73 
 
 
304 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  39.09 
 
 
332 aa  224  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  40.4 
 
 
304 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  41.01 
 
 
329 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  39.47 
 
 
327 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  40.07 
 
 
308 aa  221  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  40 
 
 
303 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  40.26 
 
 
340 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  36.83 
 
 
328 aa  218  7.999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  40.38 
 
 
313 aa  218  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  39.07 
 
 
304 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  39.29 
 
 
307 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.83 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  40.4 
 
 
304 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.62 
 
 
317 aa  212  5.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  38.08 
 
 
320 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.51 
 
 
331 aa  210  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.72 
 
 
308 aa  209  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  39.81 
 
 
323 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  38.44 
 
 
309 aa  206  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  39.47 
 
 
300 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  40 
 
 
325 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.74 
 
 
331 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.34 
 
 
359 aa  206  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6251  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.36 
 
 
353 aa  205  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382006  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  37.14 
 
 
314 aa  205  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  38.72 
 
 
309 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 
321 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  38.76 
 
 
308 aa  202  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.74 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.82 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.42 
 
 
309 aa  200  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.35 
 
 
342 aa  199  3.9999999999999996e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  35.58 
 
 
313 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0617  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.26 
 
 
329 aa  198  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899529  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.4 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.72 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1263  ABC transporter related  45.45 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.600052  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  35.48 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.71 
 
 
332 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.94 
 
 
343 aa  196  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1482  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.31 
 
 
344 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000625937  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.17 
 
 
343 aa  195  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23580  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.66 
 
 
324 aa  195  8.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.185553  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.16 
 
 
322 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.77 
 
 
334 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5171  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
329 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.86 
 
 
338 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.33 
 
 
322 aa  192  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>