More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4231 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  100 
 
 
304 aa  619  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  59.74 
 
 
305 aa  357  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  59.08 
 
 
305 aa  353  1e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  58.42 
 
 
305 aa  353  2e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  46.23 
 
 
319 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  47.52 
 
 
301 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  46.53 
 
 
310 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  47.7 
 
 
310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  47.87 
 
 
305 aa  268  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  46.18 
 
 
283 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  45.51 
 
 
308 aa  266  4e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  47.54 
 
 
301 aa  265  5e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  46.53 
 
 
300 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  46.84 
 
 
295 aa  263  4e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  43.42 
 
 
302 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 
294 aa  242  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  53.27 
 
 
254 aa  242  7e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  42.14 
 
 
306 aa  241  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  42.09 
 
 
326 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  41.61 
 
 
322 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  44.11 
 
 
284 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  48.59 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  42.24 
 
 
299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  41.86 
 
 
314 aa  232  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  44.04 
 
 
293 aa  230  3e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  42.12 
 
 
304 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.26 
 
 
339 aa  229  4e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  40.33 
 
 
741 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  52.34 
 
 
256 aa  228  9e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  42.39 
 
 
311 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 
280 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  41.53 
 
 
321 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.68 
 
 
328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  41.37 
 
 
320 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  41.37 
 
 
320 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  42.11 
 
 
330 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  39.53 
 
 
322 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  42.62 
 
 
308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  41.58 
 
 
303 aa  222  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  39.23 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  40.26 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  42.95 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  41.04 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  42.21 
 
 
315 aa  219  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  37.62 
 
 
311 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
331 aa  219  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  40.97 
 
 
304 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  40.13 
 
 
308 aa  218  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  39.94 
 
 
308 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  38.76 
 
 
312 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.94 
 
 
328 aa  217  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  40.33 
 
 
756 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  39.2 
 
 
305 aa  217  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  39.81 
 
 
304 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  39.81 
 
 
320 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  40.44 
 
 
326 aa  215  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  39.67 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.37 
 
 
308 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  41.03 
 
 
345 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  39.81 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  39.46 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  39.81 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  51.15 
 
 
237 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  41.25 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 
322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  40.32 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  40.97 
 
 
304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  40.97 
 
 
304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  40.97 
 
 
304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  40.97 
 
 
306 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.59 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  40.97 
 
 
351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  40.32 
 
 
344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  41.31 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.51 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  40.58 
 
 
342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  40.97 
 
 
351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  40.97 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  40.78 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  41.35 
 
 
355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.59 
 
 
327 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.78 
 
 
343 aa  212  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.17 
 
 
308 aa  212  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  41.29 
 
 
304 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  42.07 
 
 
310 aa  212  7.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  39.48 
 
 
326 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  38.94 
 
 
312 aa  211  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  38.91 
 
 
311 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.89 
 
 
279 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  38.19 
 
 
310 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  39.48 
 
 
322 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  39.61 
 
 
304 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  39.48 
 
 
304 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  36.66 
 
 
312 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  39.09 
 
 
327 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  41.45 
 
 
319 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  36.66 
 
 
312 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  36.66 
 
 
312 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>