More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16100 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 308 aa  610  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  77.63 
 
 		 312 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  66.12 
 
 		 338 aa  391  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  62.25 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  62.42 
 
 		 310 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  64.14 
 
 		 308 aa  378  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  62.42 
 
 		 310 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  62.09 
 
 		 310 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  62.91 
 
 		 319 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  64.24 
 
 		 313 aa  368  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  61.26 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  63.31 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  62.06 
 
 		 309 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 		 302 aa  355  5.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  59.42 
 
 		 308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  60.63 
 
 		 313 aa  351  8e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  61.56 
 
 		 388 aa  348  7e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  64.16 
 
 		 374 aa  339  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  60.66 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.43 
 
 		 304 aa  321  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  55.92 
 
 		 315 aa  311  7.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  59.34 
 
 		 334 aa  302  6.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  54.69 
 
 		 329 aa  278  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  47.06 
 
 		 311 aa  265  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  49.35 
 
 		 299 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  46.71 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  45.54 
 
 		 300 aa  248  7e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  44.83 
 
 		 322 aa  242  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  43.61 
 
 		 322 aa  235  8e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  42.19 
 
 		 306 aa  221  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  41.1 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  39.35 
 
 		 305 aa  215  7e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  39.03 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  43.75 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  37.17 
 
 		 304 aa  212  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  41.2 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  42.58 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  51.38 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.47 
 
 		 331 aa  209  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  40.26 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  43.48 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  42.52 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  45.54 
 
 		 254 aa  202  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  37.09 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  36.75 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  40.13 
 
 		 331 aa  198  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.74 
 
 		 313 aa  198  9e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  40.07 
 
 		 285 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  40.58 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  40.39 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  45.13 
 
 		 284 aa  195  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  45.3 
 
 		 290 aa  195  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  49.78 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  41.53 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  48.18 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  40.33 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  45.11 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  33.77 
 
 		 308 aa  192  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  45.23 
 
 		 314 aa  192  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  33.11 
 
 		 283 aa  189  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  39.22 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  39.62 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  40.33 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  35.1 
 
 		 353 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.25 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.26 
 
 		 321 aa  186  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2085  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.17 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198089  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 317 aa  185  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.75 
 
 		 319 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 342 aa  185  9e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 314 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  37.46 
 
 		 315 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  44.69 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  46.52 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  40.45 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  35.31 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  40.38 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  35.06 
 
 		 324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.32 
 
 		 335 aa  182  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  37.62 
 
 		 306 aa  182  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  38.03 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  43.57 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  36.81 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  44.87 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  42.98 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  33.87 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 300 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.78 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  38.06 
 
 		 333 aa  179  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 		 337 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.34 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4937  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.51 
 
 		 347 aa  176  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.8 
 
 		 324 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  45.15 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6786  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.69 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00659712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>