More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14590 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
331 aa  635    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  52 
 
 
299 aa  242  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.05 
 
 
304 aa  229  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  51.93 
 
 
322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  46.62 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  52.49 
 
 
315 aa  218  7.999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  59.09 
 
 
319 aa  218  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  60.68 
 
 
334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  56.36 
 
 
329 aa  215  7e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  46.86 
 
 
312 aa  215  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  50.23 
 
 
314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  52.15 
 
 
308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  54.93 
 
 
302 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  45.32 
 
 
311 aa  211  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  52.56 
 
 
310 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  53.55 
 
 
322 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.47 
 
 
308 aa  209  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  44.95 
 
 
309 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  52.34 
 
 
313 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  55.94 
 
 
388 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  54.19 
 
 
374 aa  202  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.3 
 
 
321 aa  202  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  42.05 
 
 
300 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  49.56 
 
 
319 aa  199  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  50.46 
 
 
338 aa  196  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13320  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.24 
 
 
241 aa  196  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  51.2 
 
 
310 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  51.2 
 
 
310 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  51.2 
 
 
310 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  51.56 
 
 
308 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  51.22 
 
 
309 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  48.89 
 
 
313 aa  187  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 
280 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  44.55 
 
 
324 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.22 
 
 
286 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  42.66 
 
 
301 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  46.8 
 
 
284 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  39.91 
 
 
304 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  32.12 
 
 
308 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  48.53 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  39.85 
 
 
302 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  36.49 
 
 
310 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  40.71 
 
 
282 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  47.14 
 
 
317 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  44.67 
 
 
303 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  37.74 
 
 
283 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.65 
 
 
313 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  38.39 
 
 
305 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  46.83 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  38.52 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  43.33 
 
 
333 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  44.19 
 
 
305 aa  166  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  45.12 
 
 
324 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
301 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  33.58 
 
 
295 aa  166  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  37.91 
 
 
301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  43.51 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  43.23 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  44.08 
 
 
237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  43.43 
 
 
297 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  45.19 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  45.19 
 
 
284 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  37.28 
 
 
285 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  44.84 
 
 
295 aa  162  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  40.45 
 
 
741 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  34.73 
 
 
247 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  41.7 
 
 
756 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  40.72 
 
 
312 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  40.08 
 
 
319 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  40.87 
 
 
322 aa  159  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  41.33 
 
 
331 aa  159  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  44.72 
 
 
289 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5653  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.53 
 
 
255 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.74 
 
 
335 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 
305 aa  156  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  41.48 
 
 
303 aa  156  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  42.2 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  41.2 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  41.51 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  41.35 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  39.9 
 
 
302 aa  156  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.78 
 
 
332 aa  155  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  40.34 
 
 
326 aa  155  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 
343 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 
300 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.75 
 
 
323 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.9 
 
 
310 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  34.45 
 
 
305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  41.26 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  41.28 
 
 
308 aa  153  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  43.69 
 
 
314 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  42.04 
 
 
329 aa  153  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0326  ABC transporter related  42.58 
 
 
359 aa  153  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  decreased coverage  0.00902644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  40 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  33.75 
 
 
300 aa  152  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.72 
 
 
310 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  40.09 
 
 
312 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  38.86 
 
 
263 aa  152  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2042  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.34 
 
 
328 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025568  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  34.04 
 
 
300 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>