More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3531 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  100 
 
 		 319 aa  625  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  55.45 
 
 		 321 aa  292  6e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.48 
 
 		 347 aa  269  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  50 
 
 		 314 aa  268  7e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4839  ABC transporter related protein  56.8 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.84 
 
 		 310 aa  255  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  50.84 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  46.5 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  49.66 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  45.95 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  43.41 
 
 		 353 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  40.53 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  45.36 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  44.82 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  45.61 
 
 		 284 aa  212  9e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  43.23 
 
 		 285 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  50.93 
 
 		 301 aa  205  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  42.76 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  51.42 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  51.42 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  35.2 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  40.2 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  38.87 
 
 		 319 aa  199  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.4 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  40.26 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 301 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  39.91 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  35.48 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  33.78 
 
 		 283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  40.87 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  44.13 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  40.4 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  38.28 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  36.66 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  46.23 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  36.66 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 		 253 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  39.6 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  37.96 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  39.02 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  45.65 
 
 		 253 aa  186  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  41.33 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  41.16 
 
 		 301 aa  185  8e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  37.05 
 
 		 309 aa  185  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  36.18 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  40.67 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3148  ABC transporter related  44.54 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0680393  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  40.07 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  50.5 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  41.51 
 
 		 254 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  37.95 
 
 		 318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.86 
 
 		 313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  44.69 
 
 		 308 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3150  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  45.22 
 
 		 253 aa  182  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.962721  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  37.12 
 
 		 329 aa  182  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  46.88 
 
 		 332 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  39.29 
 
 		 284 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3240  ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3493  ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.644181  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.03 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  36.74 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3213  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  44.78 
 
 		 253 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3468  ABC transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 		 253 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000910882  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  37.17 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  37.42 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  45.54 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  41.86 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  36.84 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  38.69 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3987  amino acid adenylation domain protein  44.69 
 
 		 3786 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  46.48 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  39.3 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.92 
 
 		 324 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.06 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  38.54 
 
 		 334 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  35.53 
 
 		 309 aa  180  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  45.07 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3454  ABC transporter, ATP-binding protein  43.91 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  37.17 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 		 300 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  37.34 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  43.1 
 
 		 340 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  33.66 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  36.81 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  43.43 
 
 		 317 aa  179  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.74 
 
 		 327 aa  179  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  37.92 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  46.7 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0380  ABC transporter related  36.48 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0412  ABC transporter related  36.48 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.173041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  47.42 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  36.1 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  38.06 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  38.06 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  35.58 
 
 		 308 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>