More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7156 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  100 
 
 		 281 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  59.07 
 
 		 324 aa  305  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  59.07 
 
 		 324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  55.52 
 
 		 312 aa  295  7e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  53.43 
 
 		 280 aa  291  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  56.68 
 
 		 301 aa  289  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  56.36 
 
 		 304 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  54.8 
 
 		 300 aa  288  7e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.82 
 
 		 286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  55.84 
 
 		 284 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  53.6 
 
 		 276 aa  275  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  54.32 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  52.35 
 
 		 301 aa  271  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  52.9 
 
 		 290 aa  269  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  52.9 
 
 		 282 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  54.15 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  51.62 
 
 		 294 aa  258  7e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  53.93 
 
 		 289 aa  256  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.62 
 
 		 313 aa  250  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  51.08 
 
 		 297 aa  248  7e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  51.81 
 
 		 317 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  50.18 
 
 		 285 aa  225  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  41.56 
 
 		 314 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  40.73 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  37.86 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  39.47 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  45.81 
 
 		 312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  46.02 
 
 		 309 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  40.14 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3148  ABC transporter related  40.21 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0680393  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  41.86 
 
 		 319 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  39.8 
 
 		 326 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  47.39 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  39.86 
 
 		 253 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  47.66 
 
 		 319 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  37.67 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.29 
 
 		 308 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  38.08 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  38.08 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  38.08 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  39.05 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  40.63 
 
 		 342 aa  176  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  42.15 
 
 		 333 aa  175  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3240  ABC transporter ATP-binding protein  39.5 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3493  ABC transporter ATP-binding protein  39.5 
 
 		 253 aa  175  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.644181  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3150  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  39.5 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.962721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3454  ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3468  ABC transporter, ATP-binding protein  39.86 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000910882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3213  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  39.15 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  47.44 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 300 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  34.67 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  47.66 
 
 		 374 aa  171  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  39.53 
 
 		 741 aa  171  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.78 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  39.8 
 
 		 314 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3447  ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0135545  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  36.57 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  44.7 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  42.74 
 
 		 331 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  38.74 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  44.39 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  46.05 
 
 		 315 aa  168  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  44.84 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 		 305 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  47.21 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  32.03 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  38.64 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  40.43 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  46.96 
 
 		 302 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  40.39 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  33.89 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  43.42 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  43.42 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  36.39 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2485  ABC transporter related  43.81 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  37.87 
 
 		 306 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  37.96 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  48.21 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 306 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  43.86 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  32.44 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0326  ABC transporter related  43.17 
 
 		 359 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  decreased coverage  0.00902644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  38.05 
 
 		 756 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.75 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  31.65 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  31.99 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0286  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.73 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  36.17 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8858  ABC transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1188  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000880668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2471  ABC transporter related protein  42.14 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0608955  hitchhiker  0.00400758 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.91 
 
 		 347 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>