More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03830 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
347 aa  684    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  54.18 
 
 
321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  50.8 
 
 
319 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.63 
 
 
310 aa  271  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4839  ABC transporter related protein  54.1 
 
 
314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  48.18 
 
 
302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  47.68 
 
 
309 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  43.52 
 
 
324 aa  238  9e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  43.61 
 
 
314 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  42.32 
 
 
353 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  47.04 
 
 
323 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  44.64 
 
 
343 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  42.41 
 
 
330 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  45.26 
 
 
285 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.73 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  47.84 
 
 
301 aa  196  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  35.82 
 
 
304 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  48.62 
 
 
301 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  38.14 
 
 
308 aa  189  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  33.01 
 
 
308 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  40.45 
 
 
309 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  40.13 
 
 
319 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  33.76 
 
 
310 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  38.1 
 
 
300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  47.13 
 
 
289 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  47.32 
 
 
276 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  37.3 
 
 
309 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  45.91 
 
 
301 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  37.97 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  41.67 
 
 
322 aa  179  7e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  32.8 
 
 
305 aa  179  8e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
331 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  36.81 
 
 
302 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  42.52 
 
 
311 aa  178  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  42.45 
 
 
310 aa  177  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  44.78 
 
 
290 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  38.08 
 
 
314 aa  176  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  38.34 
 
 
310 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  37.14 
 
 
299 aa  176  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  38.34 
 
 
310 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  38.34 
 
 
310 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  35.48 
 
 
319 aa  176  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  45.25 
 
 
282 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  43.2 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  32.8 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  34.49 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  37.82 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  33.12 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  36.57 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  46.39 
 
 
280 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  39.73 
 
 
340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  37.97 
 
 
308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.85 
 
 
313 aa  172  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  35.69 
 
 
303 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  31.56 
 
 
310 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  44.05 
 
 
317 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  42.06 
 
 
310 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  37.14 
 
 
312 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  48.42 
 
 
297 aa  170  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  43.84 
 
 
284 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  37.76 
 
 
315 aa  170  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  37.67 
 
 
304 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  30.59 
 
 
283 aa  169  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  33.89 
 
 
323 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  36.88 
 
 
313 aa  169  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  39.01 
 
 
388 aa  169  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  37.01 
 
 
308 aa  169  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  36.52 
 
 
319 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  38.1 
 
 
303 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  34.24 
 
 
300 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  36.36 
 
 
311 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  39.51 
 
 
330 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  37.54 
 
 
302 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2770  ABC transporter related  36.56 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  36.61 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  36.59 
 
 
303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  38.3 
 
 
324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  36.95 
 
 
338 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  33.12 
 
 
305 aa  166  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  32.09 
 
 
307 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  42.45 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  43.04 
 
 
312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  44.61 
 
 
374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  44.22 
 
 
322 aa  165  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  32.66 
 
 
295 aa  166  8e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  34.29 
 
 
302 aa  165  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  35.86 
 
 
246 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  41.12 
 
 
294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.84 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.51 
 
 
319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0582  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  35.23 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  34.6 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  34.01 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  34.01 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  34.49 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
300 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  32.79 
 
 
301 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  44.72 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>