More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33070 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 286 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  50.51 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  54.14 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  53.82 
 
 		 281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  52.22 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  54.7 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  52.6 
 
 		 324 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  52.35 
 
 		 301 aa  259  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  51.46 
 
 		 301 aa  254  8e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  50.36 
 
 		 301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  48.16 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  50.36 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  50.18 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  49.27 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  51.82 
 
 		 294 aa  232  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  47.25 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  47.99 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  49.82 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  51.64 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 317 aa  221  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  44.72 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  40.79 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  43.06 
 
 		 388 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  40.52 
 
 		 309 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  42.16 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  40.94 
 
 		 374 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  47 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  35.48 
 
 		 283 aa  185  9e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  38.19 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  40.07 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  43.81 
 
 		 308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.54 
 
 		 304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.22 
 
 		 331 aa  180  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  45.09 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  45.09 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  45.09 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  31.56 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  43.36 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  33.1 
 
 		 305 aa  175  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  44.89 
 
 		 319 aa  175  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  44.14 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  43.06 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  34.9 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  36.84 
 
 		 314 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  32.76 
 
 		 301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  31.89 
 
 		 308 aa  172  5e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 338 aa  172  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  39.32 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  38.97 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  42.19 
 
 		 324 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  36.51 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.51 
 
 		 308 aa  169  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 333 aa  168  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  40.53 
 
 		 322 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  42.29 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  37.71 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  39.64 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.75 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  41.41 
 
 		 314 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  42.04 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  37.54 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  35.84 
 
 		 294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1188  ABC transporter related protein  44.89 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000880668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.67 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  39.69 
 
 		 305 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  40.6 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  37.37 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  42.51 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  45.1 
 
 		 321 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  39.83 
 
 		 322 aa  162  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  42.03 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  36.94 
 
 		 300 aa  161  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.84 
 
 		 347 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  30.41 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  40.67 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  38.68 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  35.12 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  32.61 
 
 		 254 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  35.22 
 
 		 300 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  42.98 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  31.52 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  41.85 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.4 
 
 		 321 aa  159  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  36.42 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  35.33 
 
 		 305 aa  159  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  30.64 
 
 		 300 aa  158  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2770  ABC transporter related  39.17 
 
 		 319 aa  157  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  39.21 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  36.96 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  38.73 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  40 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  41.41 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>