More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0505 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  100 
 
 
323 aa  642    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  54.58 
 
 
314 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  56.9 
 
 
302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  51.66 
 
 
321 aa  273  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.83 
 
 
310 aa  266  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  48.87 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  50.84 
 
 
319 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  42.94 
 
 
353 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  47.52 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  44.33 
 
 
309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.96 
 
 
347 aa  218  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  42.14 
 
 
343 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  50.9 
 
 
284 aa  203  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4839  ABC transporter related protein  56.88 
 
 
314 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
300 aa  202  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  51.94 
 
 
301 aa  199  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  46.9 
 
 
280 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  50.45 
 
 
276 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  48.92 
 
 
301 aa  192  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  39.05 
 
 
319 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  48.66 
 
 
301 aa  189  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  34.23 
 
 
308 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  49.76 
 
 
282 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  49.76 
 
 
290 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  47.53 
 
 
285 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  38.8 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  47.86 
 
 
317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  41.86 
 
 
330 aa  182  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.14 
 
 
313 aa  182  9.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.79 
 
 
313 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  43.08 
 
 
301 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  46.83 
 
 
284 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  47.71 
 
 
289 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  40.36 
 
 
310 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  51.76 
 
 
297 aa  176  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 
253 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2085  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.54 
 
 
318 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  46.41 
 
 
322 aa  176  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  43.12 
 
 
253 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  33.45 
 
 
283 aa  176  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  39.34 
 
 
303 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5589  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.22 
 
 
327 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  39.26 
 
 
312 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  51.52 
 
 
294 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
306 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  40.47 
 
 
305 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1188  ABC transporter related protein  44.89 
 
 
262 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  unclonable  0.00000880668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.91 
 
 
338 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.64 
 
 
335 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.66 
 
 
312 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3454  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 
253 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  41.67 
 
 
319 aa  169  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3468  ABC transporter, ATP-binding protein  42.2 
 
 
253 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000910882  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3240  ABC transporter ATP-binding protein  41.28 
 
 
253 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3493  ABC transporter ATP-binding protein  41.28 
 
 
253 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.644181  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  40 
 
 
301 aa  169  9e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3213  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  41.28 
 
 
253 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.13 
 
 
316 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3150  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  41.28 
 
 
253 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.962721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3148  ABC transporter related  41.28 
 
 
253 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0680393  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  38.57 
 
 
303 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  41.63 
 
 
322 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  44.09 
 
 
302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  40.89 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.44 
 
 
331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.58 
 
 
353 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.99 
 
 
343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  39.23 
 
 
304 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3254  hypothetical protein  41.91 
 
 
331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0305467  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  40.98 
 
 
308 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3447  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
253 aa  165  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0135545  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.75 
 
 
323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4655  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.54 
 
 
449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  45.62 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2017  ABC transporter related  45.87 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  44.83 
 
 
756 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  42.13 
 
 
263 aa  163  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  43.12 
 
 
308 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  44.39 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.26 
 
 
362 aa  162  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  45.07 
 
 
309 aa  162  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  33.22 
 
 
305 aa  162  7e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  44.7 
 
 
323 aa  162  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2101  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.08 
 
 
335 aa  162  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.45 
 
 
345 aa  162  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  45.78 
 
 
281 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  40.83 
 
 
253 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0599  ABC transporter related protein  48.21 
 
 
287 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  41.07 
 
 
315 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.13 
 
 
331 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2064  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.67 
 
 
335 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.43 
 
 
338 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8858  ABC transporter ATP-binding protein  43.12 
 
 
275 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  39.91 
 
 
312 aa  161  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.5 
 
 
321 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2770  ABC transporter related  39.83 
 
 
319 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  38.21 
 
 
311 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.02 
 
 
446 aa  160  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 
305 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.22 
 
 
332 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.351465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>