More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1585 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  100 
 
 
321 aa  619  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.96 
 
 
347 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.9 
 
 
310 aa  301  7.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  52.05 
 
 
314 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  55.45 
 
 
319 aa  292  7e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  57.49 
 
 
302 aa  280  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  51.66 
 
 
323 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4839  ABC transporter related protein  60 
 
 
314 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  47.35 
 
 
353 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  48.37 
 
 
309 aa  249  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  47.33 
 
 
324 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  45.85 
 
 
343 aa  235  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  47.04 
 
 
330 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.93 
 
 
310 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  50 
 
 
301 aa  209  6e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  47.06 
 
 
285 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  51.06 
 
 
276 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  47.56 
 
 
280 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  51.66 
 
 
301 aa  199  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  40.65 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  41.03 
 
 
300 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  50.22 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  51.33 
 
 
301 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  50.95 
 
 
282 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  50.48 
 
 
290 aa  192  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  40.59 
 
 
309 aa  192  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.44 
 
 
304 aa  192  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  33.65 
 
 
308 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  52.45 
 
 
317 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.46 
 
 
338 aa  189  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 
362 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.22 
 
 
308 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  39.14 
 
 
308 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
299 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  38.73 
 
 
306 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  45.33 
 
 
314 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  37.21 
 
 
312 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  41 
 
 
303 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  49.28 
 
 
313 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.14 
 
 
313 aa  185  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  54.21 
 
 
297 aa  186  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  50.23 
 
 
289 aa  185  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.82 
 
 
323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  43.32 
 
 
302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  39.53 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  41.88 
 
 
299 aa  182  9.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  50 
 
 
284 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  38.49 
 
 
308 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  34.64 
 
 
305 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  43.15 
 
 
256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  36.48 
 
 
256 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.55 
 
 
353 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  41.67 
 
 
304 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  35.67 
 
 
305 aa  179  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  42.72 
 
 
303 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  29.8 
 
 
283 aa  178  8e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  38.46 
 
 
319 aa  178  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  42.97 
 
 
322 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  34.64 
 
 
305 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  35 
 
 
310 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  47.37 
 
 
304 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
253 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3148  ABC transporter related  40.95 
 
 
253 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0680393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3240  ABC transporter ATP-binding protein  41.81 
 
 
253 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3493  ABC transporter ATP-binding protein  41.81 
 
 
253 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.644181  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.75 
 
 
316 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  34.31 
 
 
305 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.76 
 
 
316 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3454  ABC transporter, ATP-binding protein  40.95 
 
 
253 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 
253 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3150  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  41.81 
 
 
253 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.962721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3447  ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 
253 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0135545  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  45.54 
 
 
315 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  44.55 
 
 
310 aa  175  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4937  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.94 
 
 
347 aa  175  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691547  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
302 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3213  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  41.38 
 
 
253 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  36.82 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3468  ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 
253 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000910882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6786  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.13 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00659712  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  45.54 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  44.64 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  38.85 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  38.57 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.48 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3915  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.96 
 
 
327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  40.92 
 
 
330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  39.67 
 
 
320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  39.82 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  39.8 
 
 
303 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.87 
 
 
313 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  33.67 
 
 
300 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  40.25 
 
 
312 aa  172  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.05 
 
 
312 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  39.64 
 
 
310 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  50 
 
 
294 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  40.54 
 
 
316 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4762  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.73 
 
 
309 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000635501  hitchhiker  0.0000711162 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.05 
 
 
320 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>