More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1677 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 353 aa  688    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  54.52 
 
 		 314 aa  315  8e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  51.92 
 
 		 324 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  50.76 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  47.35 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  48.92 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.7 
 
 		 310 aa  239  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  43.41 
 
 		 319 aa  235  7e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  42.94 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  52.34 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.91 
 
 		 347 aa  224  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 285 aa  215  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  44.05 
 
 		 343 aa  212  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  35.65 
 
 		 283 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  40.06 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4839  ABC transporter related protein  45.59 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  48.09 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  39.04 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  44.88 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  48.09 
 
 		 276 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  40.24 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  39.64 
 
 		 282 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  38.21 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  39.94 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  37.54 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  39.52 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  37.54 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  33.93 
 
 		 308 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  37.54 
 
 		 305 aa  192  8e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.84 
 
 		 304 aa  192  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  47.44 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  36.09 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  46.52 
 
 		 280 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  37.79 
 
 		 312 aa  190  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  39.68 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.86 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  39.46 
 
 		 313 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  38.4 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  43.21 
 
 		 314 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.1 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  41.09 
 
 		 301 aa  186  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  35.99 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  37.76 
 
 		 302 aa  184  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  42.9 
 
 		 317 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  38.51 
 
 		 388 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  35.78 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  39 
 
 		 256 aa  182  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  41.06 
 
 		 305 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.52 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  48.62 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  40.3 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  34.72 
 
 		 300 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  36.2 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  42.17 
 
 		 319 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  40.65 
 
 		 301 aa  180  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  41.04 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  38.78 
 
 		 310 aa  179  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  37.73 
 
 		 256 aa  179  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  39.44 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  36.29 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  37.42 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  36.66 
 
 		 322 aa  177  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  34.23 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 		 300 aa  177  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.24 
 
 		 316 aa  176  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  38.38 
 
 		 303 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  38.1 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  44.3 
 
 		 284 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  37.45 
 
 		 247 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  37.72 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2770  ABC transporter related  37.91 
 
 		 319 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  37.8 
 
 		 330 aa  172  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39 
 
 		 319 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  34.59 
 
 		 308 aa  172  9e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  40.32 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3454  ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 253 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  40.32 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  40.33 
 
 		 246 aa  171  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3240  ABC transporter ATP-binding protein  40.91 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3213  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  40.91 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3150  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  41.32 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.962721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3493  ABC transporter ATP-binding protein  40.91 
 
 		 253 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.644181  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  38.37 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  40.32 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.55 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  34.71 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  45.5 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>