More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3067 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  76.71 
 
 		 256 aa  396  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  42.07 
 
 		 319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  53.27 
 
 		 304 aa  242  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  57.21 
 
 		 305 aa  241  7e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  56.28 
 
 		 305 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  56.28 
 
 		 305 aa  238  5e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  40.98 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  50.23 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  49.28 
 
 		 322 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  43.31 
 
 		 283 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  43.94 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  43.94 
 
 		 305 aa  223  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.35 
 
 		 310 aa  222  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  47.96 
 
 		 301 aa  221  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  48.85 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  47.73 
 
 		 303 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  48.37 
 
 		 322 aa  218  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  47.98 
 
 		 312 aa  215  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  39.71 
 
 		 285 aa  215  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  43.14 
 
 		 256 aa  214  9e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  47.81 
 
 		 299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  48.17 
 
 		 310 aa  211  9e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  45.58 
 
 		 331 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  44.74 
 
 		 326 aa  209  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  44.7 
 
 		 312 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  44.29 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  41.8 
 
 		 302 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  44.75 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  45.24 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  46.6 
 
 		 309 aa  205  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  46.98 
 
 		 295 aa  204  7e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  45.87 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  42.92 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  45.37 
 
 		 280 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  45.07 
 
 		 308 aa  202  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  46.51 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.54 
 
 		 308 aa  202  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  45.33 
 
 		 314 aa  202  6e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 330 aa  201  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  48.64 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  43.66 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  40 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  42.25 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  47.75 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  44.95 
 
 		 741 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.03 
 
 		 343 aa  196  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  41.45 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  46.61 
 
 		 328 aa  195  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.55 
 
 		 326 aa  195  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.07 
 
 		 279 aa  195  7e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  41.23 
 
 		 284 aa  194  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.4 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  43.66 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  44.29 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  45.07 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  43.66 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  43.86 
 
 		 312 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  44.84 
 
 		 328 aa  192  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.74 
 
 		 316 aa  192  4e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.55 
 
 		 328 aa  192  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  40.28 
 
 		 330 aa  191  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  42.72 
 
 		 310 aa  191  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  44.6 
 
 		 374 aa  191  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2770  ABC transporter related  43.44 
 
 		 319 aa  191  8e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  41.41 
 
 		 585 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.72 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  43.3 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  38.89 
 
 		 590 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  42.2 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  46.98 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.57 
 
 		 319 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  39.22 
 
 		 317 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  44.14 
 
 		 306 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  39.68 
 
 		 353 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  39.92 
 
 		 581 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  43.66 
 
 		 308 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  43.38 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  43.81 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  44.59 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  42.15 
 
 		 246 aa  188  5.999999999999999e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  37.17 
 
 		 315 aa  188  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.6 
 
 		 339 aa  188  7e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  37.88 
 
 		 293 aa  188  7e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.11 
 
 		 324 aa  188  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 330 aa  188  8e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  39.47 
 
 		 314 aa  188  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  44.6 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  43.12 
 
 		 756 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  44.22 
 
 		 388 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  44.04 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  38.89 
 
 		 590 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.63 
 
 		 329 aa  187  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 293 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  40.09 
 
 		 289 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  44.66 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.09 
 
 		 279 aa  186  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>