More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3622 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  100 
 
 		 290 aa  580  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  94.33 
 
 		 282 aa  529  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  65.59 
 
 		 301 aa  345  4e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  64.23 
 
 		 280 aa  344  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  64.06 
 
 		 301 aa  343  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  66.42 
 
 		 284 aa  342  5e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  64.73 
 
 		 284 aa  335  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  63.5 
 
 		 276 aa  328  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  58.78 
 
 		 317 aa  305  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  59.51 
 
 		 289 aa  305  9.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  61.15 
 
 		 294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  59.14 
 
 		 301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.84 
 
 		 313 aa  293  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  56.18 
 
 		 285 aa  292  5e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  58.99 
 
 		 297 aa  289  3e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  52.9 
 
 		 281 aa  269  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  48.08 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  46.1 
 
 		 312 aa  235  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  47.18 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  47.57 
 
 		 324 aa  231  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.25 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  45.58 
 
 		 304 aa  223  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  40.29 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  38.8 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  41.69 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  41.78 
 
 		 319 aa  208  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  44.29 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  49.76 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  45.32 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  36.75 
 
 		 308 aa  206  4e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  46.3 
 
 		 302 aa  205  9e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  48.66 
 
 		 315 aa  203  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  41.47 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  39.43 
 
 		 305 aa  203  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  41.2 
 
 		 308 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  44.44 
 
 		 256 aa  201  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  39.4 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  40.33 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  51.42 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  41.47 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  39.07 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 		 305 aa  199  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  40.52 
 
 		 342 aa  198  7e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  40.8 
 
 		 319 aa  199  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.14 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  40.8 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  48.46 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  40.82 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  42 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.3 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 306 aa  195  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  41.16 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  41.16 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  42.95 
 
 		 309 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  39.52 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  42.46 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  40.82 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  50.48 
 
 		 321 aa  192  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  48.13 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  40.79 
 
 		 313 aa  192  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 300 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  48.54 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  41.2 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.33 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  38.65 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 		 253 aa  188  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  38.65 
 
 		 300 aa  188  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  35.4 
 
 		 295 aa  187  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  45.79 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  38.87 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  49.76 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  49.28 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  39.35 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  41.55 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  37.37 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  41.22 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  43.18 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 237 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  40.27 
 
 		 322 aa  185  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  42.75 
 
 		 310 aa  185  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.22 
 
 		 310 aa  185  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  49.3 
 
 		 343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  39.2 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2485  ABC transporter related  39.8 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.382581  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2802  ABC transporter related  41.1 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  37.38 
 
 		 312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  39.44 
 
 		 388 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0326  ABC transporter related  39.61 
 
 		 359 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  decreased coverage  0.00902644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  45.45 
 
 		 330 aa  182  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 299 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>