More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0672 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  100 
 
 
289 aa  550  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  64.89 
 
 
301 aa  315  5e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  58.21 
 
 
280 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  62.32 
 
 
284 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  61.48 
 
 
301 aa  310  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  62.77 
 
 
317 aa  308  6.999999999999999e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  60.21 
 
 
282 aa  306  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  59.51 
 
 
290 aa  305  9.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  59.71 
 
 
284 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  61.21 
 
 
301 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  61.84 
 
 
313 aa  293  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  60.22 
 
 
276 aa  292  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  62.95 
 
 
294 aa  291  9e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  61.48 
 
 
297 aa  287  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  53.93 
 
 
281 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  51.07 
 
 
285 aa  238  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  49.49 
 
 
304 aa  231  8.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.82 
 
 
286 aa  229  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  47.22 
 
 
312 aa  224  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  48.6 
 
 
300 aa  218  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  48.81 
 
 
324 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  49.66 
 
 
324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  39.21 
 
 
283 aa  206  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  36.67 
 
 
308 aa  199  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  38.59 
 
 
304 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  36.33 
 
 
295 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  46.34 
 
 
300 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  37.28 
 
 
305 aa  192  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  43.48 
 
 
310 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  36.93 
 
 
301 aa  190  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.73 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  51.63 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  40.91 
 
 
308 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  40.09 
 
 
300 aa  188  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
300 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
300 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  40.09 
 
 
254 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 
300 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  47.3 
 
 
319 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  45.81 
 
 
331 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  50.23 
 
 
321 aa  185  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  47.06 
 
 
308 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  47.39 
 
 
302 aa  185  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 
300 aa  185  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  40 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  40.09 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 
300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  45.37 
 
 
312 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  43.45 
 
 
310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  43.45 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  43.45 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  46.02 
 
 
302 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  40.3 
 
 
353 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 
300 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  48.31 
 
 
322 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  47.96 
 
 
308 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  35.12 
 
 
305 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  38.69 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.88 
 
 
347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.98 
 
 
308 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
305 aa  179  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  47.87 
 
 
299 aa  179  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  40.09 
 
 
299 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  41.89 
 
 
256 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  45.73 
 
 
314 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  47.71 
 
 
323 aa  178  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  38.87 
 
 
300 aa  178  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  40.74 
 
 
322 aa  178  9e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  47.69 
 
 
314 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  38.59 
 
 
301 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  45.12 
 
 
315 aa  176  5e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  46.19 
 
 
338 aa  176  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  44.69 
 
 
314 aa  175  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  41.78 
 
 
312 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 
253 aa  175  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.52 
 
 
310 aa  175  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  41.18 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  44.34 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  44.21 
 
 
322 aa  174  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  39.86 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  45.91 
 
 
313 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  41.1 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  47.03 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  46.01 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  42.66 
 
 
298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  46.57 
 
 
388 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 
293 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  50 
 
 
303 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  44.89 
 
 
313 aa  172  5e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  44.55 
 
 
312 aa  172  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 
253 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  45.54 
 
 
311 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  47.14 
 
 
374 aa  171  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3148  ABC transporter related  45.05 
 
 
253 aa  171  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0680393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0286  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.2 
 
 
307 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>