More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0794 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 305 aa  622  1e-177  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  98.36 
 
 		 305 aa  615  1e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  95.08 
 
 		 305 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  59.08 
 
 		 304 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  49.03 
 
 		 319 aa  293  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  47.08 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  46.75 
 
 		 310 aa  266  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  46.43 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 301 aa  258  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  45.02 
 
 		 308 aa  258  8e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  46.1 
 
 		 301 aa  258  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  47.35 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  57.21 
 
 		 254 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  43.56 
 
 		 302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  46.05 
 
 		 283 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  44.92 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  44.74 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  44.37 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  45.03 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  44.04 
 
 		 302 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  43.38 
 
 		 330 aa  241  7.999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  43 
 
 		 314 aa  238  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  49.15 
 
 		 256 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  43.46 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  41.39 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 		 302 aa  235  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  42.14 
 
 		 326 aa  233  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 331 aa  232  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  43.51 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  40.66 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  40.97 
 
 		 309 aa  228  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  38.68 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  41.61 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  40.78 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  41.95 
 
 		 303 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  41.94 
 
 		 315 aa  225  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  43.73 
 
 		 388 aa  225  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  40.13 
 
 		 294 aa  224  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  39.34 
 
 		 312 aa  222  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  43.14 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  39.87 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.35 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  38.75 
 
 		 311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 285 aa  219  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.85 
 
 		 328 aa  218  7.999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  41.12 
 
 		 313 aa  218  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  41.72 
 
 		 374 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  39.87 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  41.16 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  40.92 
 
 		 756 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  40.95 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  40.37 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.74 
 
 		 343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  39.88 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  39.1 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  38.96 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.38 
 
 		 328 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.62 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  42.75 
 
 		 263 aa  212  7e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.98 
 
 		 328 aa  211  9e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  37.94 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.39 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.29 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.56 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  38.72 
 
 		 284 aa  209  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  41.53 
 
 		 317 aa  209  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.5 
 
 		 339 aa  209  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.06 
 
 		 329 aa  209  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  40.13 
 
 		 304 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  40.13 
 
 		 304 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  42.05 
 
 		 290 aa  209  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  38.73 
 
 		 327 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.37 
 
 		 308 aa  208  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  39.81 
 
 		 304 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  40.13 
 
 		 304 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  39.07 
 
 		 741 aa  208  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  38.87 
 
 		 322 aa  208  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  40.13 
 
 		 326 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  40.14 
 
 		 319 aa  208  9e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  50.93 
 
 		 237 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  39.81 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  40 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  38.8 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  37.74 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  37.9 
 
 		 307 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  37.7 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  38.26 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  38.8 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  40.45 
 
 		 351 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  38.26 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  39.42 
 
 		 312 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  39.68 
 
 		 311 aa  206  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  40.45 
 
 		 351 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  40.78 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>