More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3480 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  100 
 
 
319 aa  634    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  46.08 
 
 
330 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  43.28 
 
 
306 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  43.05 
 
 
303 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  41.45 
 
 
304 aa  211  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  43.88 
 
 
331 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  43 
 
 
319 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
338 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  42.43 
 
 
302 aa  209  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  43.23 
 
 
299 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  49.57 
 
 
322 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  41.84 
 
 
310 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  41.84 
 
 
302 aa  201  9e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  40.14 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  39.79 
 
 
305 aa  200  3e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  39.94 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  39.46 
 
 
305 aa  199  6e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  39.94 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  42.9 
 
 
308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  47.09 
 
 
284 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  43.23 
 
 
741 aa  195  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  43.36 
 
 
322 aa  195  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  39.48 
 
 
308 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  48.17 
 
 
301 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.33 
 
 
308 aa  192  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  39.43 
 
 
312 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  38.71 
 
 
326 aa  192  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  39.34 
 
 
303 aa  192  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  38.87 
 
 
283 aa  191  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  36.42 
 
 
308 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  47.74 
 
 
300 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  50.48 
 
 
301 aa  188  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  43.8 
 
 
310 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  44.01 
 
 
290 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  36.9 
 
 
305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  43.37 
 
 
323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  39.03 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  40.32 
 
 
308 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  47.98 
 
 
276 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  44.55 
 
 
256 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  40.06 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
314 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  38.16 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  41.04 
 
 
254 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  40.79 
 
 
309 aa  182  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  47.29 
 
 
282 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  38.41 
 
 
309 aa  182  9.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.06 
 
 
304 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  41.77 
 
 
329 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  38.16 
 
 
319 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  46.53 
 
 
314 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  47.64 
 
 
301 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  38.77 
 
 
256 aa  180  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  39.47 
 
 
310 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  48.51 
 
 
237 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  44.7 
 
 
290 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.51 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  39.47 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  46.51 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  39.47 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  39.67 
 
 
313 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.25 
 
 
331 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  39.94 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  41.16 
 
 
374 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  36.83 
 
 
312 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  35.62 
 
 
307 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  42.21 
 
 
388 aa  179  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  38.36 
 
 
325 aa  179  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  32.32 
 
 
305 aa  178  8e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  38.46 
 
 
321 aa  178  9e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  38.22 
 
 
307 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  39.31 
 
 
319 aa  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  46.08 
 
 
324 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  48.26 
 
 
285 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  36.96 
 
 
332 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  39.54 
 
 
302 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  35.67 
 
 
295 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  40 
 
 
756 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  36.77 
 
 
315 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  38.24 
 
 
343 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 
294 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  37.87 
 
 
303 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  42.3 
 
 
308 aa  176  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  40 
 
 
310 aa  176  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  41.48 
 
 
512 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  36.73 
 
 
293 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6251  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.82 
 
 
353 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382006  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  46.5 
 
 
284 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  39.61 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  39.27 
 
 
343 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  41.13 
 
 
319 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.42 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.21 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3497  ABC transporter related protein  40.69 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.56 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  42.16 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  42.18 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  38.82 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  40.75 
 
 
297 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  36.64 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>