More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0720 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  100 
 
 
305 aa  622  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  95.08 
 
 
305 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  94.75 
 
 
305 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  58.42 
 
 
304 aa  363  1e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  47.73 
 
 
319 aa  287  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  47.73 
 
 
310 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  46.58 
 
 
310 aa  263  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  45.45 
 
 
305 aa  256  2e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  44.66 
 
 
301 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  44.04 
 
 
302 aa  256  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  44.69 
 
 
308 aa  255  6e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
306 aa  254  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  45.13 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  46.71 
 
 
283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  45.75 
 
 
295 aa  253  3e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  56.28 
 
 
254 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  44.74 
 
 
256 aa  249  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  44.19 
 
 
322 aa  248  8e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  44.59 
 
 
322 aa  248  8e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  43.56 
 
 
302 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  45.03 
 
 
293 aa  246  3e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  44.04 
 
 
299 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  43.42 
 
 
303 aa  242  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  48.73 
 
 
256 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  42.24 
 
 
330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  42.33 
 
 
314 aa  235  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  42.53 
 
 
308 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  40.43 
 
 
331 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  41.16 
 
 
309 aa  231  9e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  40.52 
 
 
302 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  40.47 
 
 
326 aa  229  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  41.91 
 
 
300 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  40.33 
 
 
308 aa  229  6e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  42.07 
 
 
315 aa  227  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  40.79 
 
 
294 aa  226  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
314 aa  225  6e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  40.26 
 
 
303 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  39.93 
 
 
308 aa  223  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  41.72 
 
 
374 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  39.87 
 
 
305 aa  223  4e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  43.54 
 
 
388 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  37.78 
 
 
312 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.49 
 
 
328 aa  222  8e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.34 
 
 
328 aa  221  9e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  40.19 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.35 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  41.31 
 
 
308 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  38.44 
 
 
311 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  40.67 
 
 
300 aa  219  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  38.91 
 
 
312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  40.19 
 
 
326 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  39.29 
 
 
315 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.13 
 
 
343 aa  216  5e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  39.68 
 
 
313 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.49 
 
 
324 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  39.13 
 
 
285 aa  215  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  40.59 
 
 
756 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  40.06 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.22 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  40.95 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  39.88 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  38.03 
 
 
309 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  38.14 
 
 
314 aa  212  7.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  40.06 
 
 
314 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  44.09 
 
 
263 aa  211  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.74 
 
 
329 aa  210  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  41.72 
 
 
290 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  37.05 
 
 
310 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  40.66 
 
 
323 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  37.05 
 
 
310 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  37.05 
 
 
310 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  38.87 
 
 
322 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  38.41 
 
 
741 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.83 
 
 
279 aa  209  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  39.87 
 
 
293 aa  209  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  36.83 
 
 
313 aa  209  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  41.53 
 
 
317 aa  209  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.85 
 
 
339 aa  209  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.78 
 
 
324 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.94 
 
 
308 aa  209  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  39.1 
 
 
312 aa  208  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  36.98 
 
 
321 aa  208  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  38.41 
 
 
327 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  36.95 
 
 
300 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.49 
 
 
326 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  40.13 
 
 
351 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  46.26 
 
 
284 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  37.58 
 
 
327 aa  207  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  37.74 
 
 
310 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  40.13 
 
 
351 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  39.35 
 
 
312 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  39.4 
 
 
290 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  39.16 
 
 
304 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  40.13 
 
 
306 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.41 
 
 
308 aa  206  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  40.13 
 
 
304 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.62 
 
 
338 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  40.13 
 
 
304 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  40.13 
 
 
304 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  40.13 
 
 
304 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>