More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2960 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  100 
 
 
314 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  54.52 
 
 
353 aa  315  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  54.46 
 
 
324 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  56.95 
 
 
330 aa  296  4e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  52.05 
 
 
321 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  54.58 
 
 
323 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.52 
 
 
310 aa  269  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  50 
 
 
319 aa  268  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  52.38 
 
 
302 aa  256  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  46.86 
 
 
309 aa  242  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4839  ABC transporter related protein  52.48 
 
 
314 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  45.1 
 
 
300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.55 
 
 
347 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  43.91 
 
 
319 aa  225  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  43.09 
 
 
285 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  46.26 
 
 
343 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  36.57 
 
 
308 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  48.53 
 
 
276 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.18 
 
 
304 aa  215  7e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  40.45 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  46.09 
 
 
284 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  52.53 
 
 
301 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  36.88 
 
 
283 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  40.94 
 
 
310 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  44.74 
 
 
309 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  44.04 
 
 
308 aa  209  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  42.57 
 
 
308 aa  208  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  42.54 
 
 
301 aa  208  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  37.22 
 
 
304 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  42.02 
 
 
315 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  41.29 
 
 
303 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  45.32 
 
 
290 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  45.24 
 
 
254 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  46.49 
 
 
282 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  45.28 
 
 
301 aa  205  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
302 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  43.51 
 
 
312 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  43.39 
 
 
388 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  41.31 
 
 
338 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  45.06 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.24 
 
 
313 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  40.2 
 
 
309 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  36.57 
 
 
310 aa  199  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  41.45 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  47.8 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  41.12 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  43.65 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  43.04 
 
 
303 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  41.1 
 
 
306 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  42.28 
 
 
322 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  38.36 
 
 
305 aa  195  7e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  43.09 
 
 
300 aa  195  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  46.29 
 
 
302 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  43.09 
 
 
300 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  43.67 
 
 
308 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.06 
 
 
313 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  42.67 
 
 
329 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  39.87 
 
 
310 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  39.87 
 
 
310 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  39.87 
 
 
310 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  41.14 
 
 
319 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  43.09 
 
 
300 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  36.66 
 
 
300 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 
300 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 
300 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
313 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2064  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.85 
 
 
335 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  44.95 
 
 
317 aa  192  9e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  42.41 
 
 
374 aa  192  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  43.1 
 
 
301 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  42.11 
 
 
300 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  44.15 
 
 
297 aa  190  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  47.16 
 
 
330 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  34.97 
 
 
295 aa  190  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  41.63 
 
 
256 aa  190  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  42.28 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  38.76 
 
 
311 aa  189  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  40.79 
 
 
320 aa  189  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10710  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.91 
 
 
316 aa  189  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  40.07 
 
 
326 aa  189  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  34.95 
 
 
305 aa  189  8e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  41.22 
 
 
300 aa  187  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  51.53 
 
 
298 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.51 
 
 
312 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  40.98 
 
 
305 aa  187  2e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  46.96 
 
 
299 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  41.56 
 
 
281 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  42.68 
 
 
299 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  39.56 
 
 
290 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  34.63 
 
 
301 aa  186  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  39.68 
 
 
312 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  50 
 
 
284 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  40.54 
 
 
310 aa  185  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  40.68 
 
 
300 aa  185  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  39.49 
 
 
306 aa  185  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5589  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.78 
 
 
327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  44.02 
 
 
331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>