More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0255 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  100 
 
 
298 aa  577  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  44.56 
 
 
320 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  43.54 
 
 
303 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  42.12 
 
 
303 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
293 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
325 aa  217  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  44.33 
 
 
305 aa  215  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  40.07 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
300 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  34.04 
 
 
300 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  34.04 
 
 
300 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  43.62 
 
 
299 aa  206  5e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  43.51 
 
 
300 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
300 aa  202  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  34.04 
 
 
299 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  33.69 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  33.33 
 
 
300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  40.28 
 
 
329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  32.63 
 
 
300 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  32.98 
 
 
300 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  42.07 
 
 
309 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.4 
 
 
311 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.8 
 
 
323 aa  188  7e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  39.74 
 
 
319 aa  188  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  51.53 
 
 
314 aa  188  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  36.09 
 
 
326 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  38.1 
 
 
309 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  38.19 
 
 
302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  47.39 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  40 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  37.89 
 
 
343 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  41.24 
 
 
312 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.2 
 
 
320 aa  178  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  40.21 
 
 
285 aa  178  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  38.95 
 
 
303 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  38.51 
 
 
306 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  39.2 
 
 
308 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  37.58 
 
 
308 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  47.96 
 
 
290 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  38.51 
 
 
306 aa  176  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  47.45 
 
 
282 aa  175  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  40 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  38.14 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  47.55 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  48.8 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  42.66 
 
 
289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  49.74 
 
 
294 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  39.02 
 
 
299 aa  172  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  47.06 
 
 
284 aa  172  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  47.62 
 
 
301 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  30.23 
 
 
308 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
280 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  45.85 
 
 
301 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  38.78 
 
 
300 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  37.88 
 
 
299 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  38.51 
 
 
330 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  37.09 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  37.32 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  35.97 
 
 
311 aa  166  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  36.92 
 
 
322 aa  165  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  34.72 
 
 
304 aa  165  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  37.46 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3497  ABC transporter related protein  36.97 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  42.99 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  36.57 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  36.57 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  36.57 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.43 
 
 
313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10190  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.66 
 
 
310 aa  161  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086698  normal  0.0445434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4839  ABC transporter related protein  47.72 
 
 
314 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.68 
 
 
286 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.94 
 
 
321 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  44.06 
 
 
343 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  43.4 
 
 
326 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  37.93 
 
 
301 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1906  ABC transporter related protein  36.97 
 
 
306 aa  159  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  35.19 
 
 
331 aa  158  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.46 
 
 
304 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  39.07 
 
 
256 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1407  ABC transporter related  25.84 
 
 
299 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.815122  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  36.72 
 
 
313 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  31.16 
 
 
305 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  43.41 
 
 
313 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1380  ABC transporter related  25.84 
 
 
299 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00611293  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  37.58 
 
 
310 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  37.38 
 
 
283 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  34.2 
 
 
319 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6376  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.77 
 
 
313 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  45.26 
 
 
319 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  36.51 
 
 
319 aa  156  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.15 
 
 
308 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  41.95 
 
 
323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2471  ABC transporter related protein  39.22 
 
 
302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0608955  hitchhiker  0.00400758 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 
305 aa  155  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0115  ABC transporter related  35.51 
 
 
302 aa  155  8e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.478521  normal  0.0830163 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  30.82 
 
 
301 aa  155  8e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  32.64 
 
 
294 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>