More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0115 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0115  ABC transporter related  100 
 
 		 302 aa  591  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.478521  normal  0.0830163 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1906  ABC transporter related protein  58.05 
 
 		 306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  54.39 
 
 		 343 aa  297  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3497  ABC transporter related protein  52.98 
 
 		 323 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  52.46 
 
 		 309 aa  271  7e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  50 
 
 		 329 aa  268  8e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01020  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.36 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  48.68 
 
 		 306 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.22 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  43.05 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  43.24 
 
 		 295 aa  221  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.86 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  35.69 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  36.03 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 		 300 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.64 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  34.68 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  41 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  34.34 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  41.58 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  37.29 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  38.61 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  37.2 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  35.79 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  37.37 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  37.79 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  39 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  37.81 
 
 		 320 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  35.44 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  34.45 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  38.03 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  37.5 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  36.4 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  37.86 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  40.32 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  36.55 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  32.88 
 
 		 311 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  38.59 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  36.68 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.54 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  33.56 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  33.33 
 
 		 283 aa  159  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  36.3 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  35.61 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  36.07 
 
 		 741 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5056  ABC transporter related  38.61 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.844299 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.58 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.56 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  35.64 
 
 		 314 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  34.14 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  37.54 
 
 		 373 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.31 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.5 
 
 		 311 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0392  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.05 
 
 		 347 aa  155  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  36.25 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  30.41 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  30.41 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  30.41 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  30.07 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  30.41 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.72 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  35.28 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  30.07 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2802  ABC transporter related  37.88 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  41.86 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.07 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.07 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  33.8 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  33.97 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  30.41 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  30.07 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  36.52 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  33.01 
 
 		 339 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  36.21 
 
 		 319 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  35.39 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1560  ABC transporter related  37.1 
 
 		 344 aa  152  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0503147  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  36.08 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  36.86 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  36.64 
 
 		 344 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  35.95 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  36.86 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  36.86 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  36.86 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  36.86 
 
 		 304 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  35.42 
 
 		 304 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  36.86 
 
 		 351 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  36.05 
 
 		 374 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  36.86 
 
 		 351 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 302 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  35.35 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  39.53 
 
 		 756 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  35.16 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>