More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01020 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01020  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 339 aa  662    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1906  ABC transporter related protein  51.82 
 
 		 306 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0115  ABC transporter related  51.03 
 
 		 302 aa  258  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.478521  normal  0.0830163 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.11 
 
 		 323 aa  245  9e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  45.83 
 
 		 343 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3497  ABC transporter related protein  46.13 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  45.34 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  48.17 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  46.78 
 
 		 329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  38.44 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.2 
 
 		 323 aa  186  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  34.45 
 
 		 300 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  42.72 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  34.23 
 
 		 300 aa  179  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 		 300 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  37.97 
 
 		 300 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  33 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  34.52 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  44.2 
 
 		 319 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  34.52 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  35.64 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  35.1 
 
 		 303 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  37.5 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  39.45 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  36.58 
 
 		 280 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  37.38 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  42.67 
 
 		 299 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  36.36 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  41.59 
 
 		 237 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  35.93 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  42.31 
 
 		 321 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  35.11 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  38.19 
 
 		 343 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  36.76 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.54 
 
 		 320 aa  146  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  43.48 
 
 		 290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.86 
 
 		 304 aa  145  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  39.83 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  38.52 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  41.99 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  37.5 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1447  ABC transporter related  39.82 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.292722  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.67 
 
 		 311 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  34.92 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  38.28 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  38.35 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  38.37 
 
 		 284 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  33.33 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.59 
 
 		 347 aa  143  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  31.27 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  34.15 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  38.72 
 
 		 301 aa  142  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  41.67 
 
 		 756 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  39.59 
 
 		 741 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  35.05 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  31.49 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  34.73 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.52 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  43 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  42.23 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  36.13 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  32.57 
 
 		 323 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  43.18 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.22 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  39.82 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  36.49 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.73 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  34.64 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  39.82 
 
 		 338 aa  140  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  33.75 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1045  ABC transporter related  33.33 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  41.41 
 
 		 314 aa  139  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  32.56 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  32.56 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  36.33 
 
 		 388 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  44.95 
 
 		 374 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  36.75 
 
 		 301 aa  139  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 297 aa  139  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  35.59 
 
 		 667 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  39.11 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  36.31 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  34.24 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  38.06 
 
 		 304 aa  138  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  42.34 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  32.24 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  30.46 
 
 		 305 aa  138  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  42.22 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  39.18 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  33.44 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0217  ABC transporter related  34.98 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.701871 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  42.22 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>