More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1076 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  100 
 
 
308 aa  619  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  53.72 
 
 
304 aa  314  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  52.79 
 
 
327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  56.15 
 
 
310 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  51.85 
 
 
322 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  51.19 
 
 
303 aa  293  3e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  52.13 
 
 
304 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  53.4 
 
 
304 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  48.99 
 
 
310 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  44.63 
 
 
310 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  45.57 
 
 
306 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  46.2 
 
 
301 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.11 
 
 
331 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  43.77 
 
 
316 aa  238  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  44 
 
 
303 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  43.93 
 
 
301 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  45.18 
 
 
318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  41.45 
 
 
298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  44.44 
 
 
301 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  40.86 
 
 
300 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  48.71 
 
 
327 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  49.57 
 
 
313 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  40.54 
 
 
325 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  45 
 
 
318 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  43.56 
 
 
301 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  45 
 
 
318 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  41.96 
 
 
344 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  41.72 
 
 
348 aa  225  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  42.61 
 
 
348 aa  225  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 
338 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  47.44 
 
 
310 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  42.27 
 
 
348 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  47.44 
 
 
310 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  51.32 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  40.73 
 
 
302 aa  219  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.58 
 
 
332 aa  218  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  40.41 
 
 
302 aa  218  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  42.52 
 
 
299 aa  218  8.999999999999998e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.9 
 
 
316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
304 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
304 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  50.44 
 
 
747 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  50 
 
 
309 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  49.33 
 
 
314 aa  209  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  42.76 
 
 
345 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  48.89 
 
 
302 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  42.09 
 
 
345 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  42.73 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  44.55 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  46.41 
 
 
292 aa  194  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  40.71 
 
 
332 aa  193  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  39.4 
 
 
310 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  36.56 
 
 
337 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  47.37 
 
 
318 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  40.21 
 
 
373 aa  189  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  39.07 
 
 
305 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  37.62 
 
 
305 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  47.37 
 
 
318 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  46.41 
 
 
318 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  44.55 
 
 
309 aa  186  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.27 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  38.83 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  43.18 
 
 
316 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  44.3 
 
 
323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  45.89 
 
 
339 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  38.72 
 
 
308 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  43.38 
 
 
250 aa  179  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
310 aa  179  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  33.12 
 
 
390 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  43.84 
 
 
356 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  41.7 
 
 
250 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  38.18 
 
 
304 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  34.67 
 
 
300 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  34.01 
 
 
302 aa  176  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  36.3 
 
 
309 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  37.33 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  40.72 
 
 
302 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2631  ABC transporter related  37.16 
 
 
301 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  38.7 
 
 
316 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
310 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  37.71 
 
 
309 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  35.45 
 
 
304 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
305 aa  170  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  40.54 
 
 
304 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  40.09 
 
 
315 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 
309 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  40.27 
 
 
318 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  37.17 
 
 
311 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  38.11 
 
 
334 aa  169  6e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  32.59 
 
 
341 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.57 
 
 
309 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.57 
 
 
309 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 
309 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  36 
 
 
298 aa  168  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  38.12 
 
 
300 aa  168  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  40.69 
 
 
350 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 
309 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  36.94 
 
 
300 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>