More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1940 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  100 
 
 		 306 aa  575  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  60.2 
 
 		 309 aa  328  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  57 
 
 		 329 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  46.86 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  53.36 
 
 		 295 aa  262  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  52.3 
 
 		 343 aa  258  6e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3497  ABC transporter related protein  49.35 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0115  ABC transporter related  48.68 
 
 		 302 aa  241  9e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.478521  normal  0.0830163 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.17 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1906  ABC transporter related protein  50.84 
 
 		 306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  44.86 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 299 aa  220  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  42 
 
 		 307 aa  219  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01020  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.17 
 
 		 339 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.88 
 
 		 323 aa  212  5.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  36.81 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 		 300 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 		 300 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  37.15 
 
 		 300 aa  209  6e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  37.85 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  36.46 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  37.85 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  44.22 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  39.74 
 
 		 303 aa  189  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  38.41 
 
 		 319 aa  185  8e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  32.79 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  40.6 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  41.25 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  36.51 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  41.53 
 
 		 299 aa  179  5.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  40.62 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  33.45 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  38.51 
 
 		 298 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  33.11 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  31.49 
 
 		 312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  32.67 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  31.49 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  31.49 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  31.49 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  31.49 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  31.49 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  31.49 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  31.49 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  31.51 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.09 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  39.75 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  39.75 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  39.43 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  32.34 
 
 		 308 aa  169  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  31.07 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.44 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  40.14 
 
 		 293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  39.87 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  33.44 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  43.42 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  45.12 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  40.69 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  43.46 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.14 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  40.39 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  40.73 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  38.76 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  32.37 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  37.86 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  39.93 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  45.5 
 
 		 276 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  40.76 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  38.59 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  47.57 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  36.34 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  39.94 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  37.54 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  41.52 
 
 		 302 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  39.55 
 
 		 323 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  38.92 
 
 		 313 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  38.36 
 
 		 741 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  29.56 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  30.87 
 
 		 283 aa  155  7e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  38.46 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0345  ABC transporter related  39.66 
 
 		 302 aa  155  8e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  38.73 
 
 		 338 aa  155  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  38.17 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  36.36 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  37.58 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  38.08 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.26 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  43.89 
 
 		 756 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  42.11 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  45.59 
 
 		 388 aa  153  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  38.76 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  36.91 
 
 		 312 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>