More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1638 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  100 
 
 		 299 aa  556  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  48.79 
 
 		 329 aa  235  8e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  49.49 
 
 		 309 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  49.32 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  44.33 
 
 		 326 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  49.14 
 
 		 295 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0115  ABC transporter related  47.2 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.478521  normal  0.0830163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  37.46 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  36.64 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 300 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  46.85 
 
 		 343 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  35.69 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  43.16 
 
 		 303 aa  208  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  36.43 
 
 		 300 aa  208  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  40.82 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  35.69 
 
 		 299 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.13 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  40.91 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  45.26 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  44.22 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  43.4 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3497  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 323 aa  188  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  42.67 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  44.53 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1906  ABC transporter related protein  41.48 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  41.31 
 
 		 300 aa  178  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  37.98 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 325 aa  175  8e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  45.24 
 
 		 300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50 
 
 		 323 aa  172  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  39.02 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  40.66 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  34.84 
 
 		 323 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  42.36 
 
 		 284 aa  166  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  43.23 
 
 		 374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.93 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01020  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.12 
 
 		 339 aa  163  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  38.82 
 
 		 308 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  45.61 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  40.27 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.78 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  39.87 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  41.99 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.91 
 
 		 320 aa  158  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  39.59 
 
 		 302 aa  158  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  46.05 
 
 		 313 aa  158  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  44.74 
 
 		 310 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  44.74 
 
 		 310 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  37.22 
 
 		 340 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  36.33 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  44.98 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  39.93 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  32.45 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  39.1 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 280 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  33.56 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  38.46 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  34.56 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  34.23 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  29.93 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  39.53 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  37.54 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  39.6 
 
 		 324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 		 323 aa  152  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  41.39 
 
 		 301 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  33.22 
 
 		 305 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  36.99 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  32.89 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  43.86 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  39.18 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  38.49 
 
 		 388 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  30.92 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  36.84 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  39.53 
 
 		 756 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  44.54 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  34.33 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.02 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  35.79 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 		 305 aa  150  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.17 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0874  ABC transporter related  33.99 
 
 		 313 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  43.22 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  36.12 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  36.12 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  36.12 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  33.11 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  44.08 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  38.59 
 
 		 326 aa  149  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  33.44 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  36.12 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>