More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0660 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  100 
 
 
313 aa  630  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  75.47 
 
 
318 aa  484  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  67.89 
 
 
303 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  64.35 
 
 
310 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  64.35 
 
 
310 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  62.87 
 
 
338 aa  376  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  61.67 
 
 
318 aa  341  8e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  61.67 
 
 
318 aa  341  8e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.21 
 
 
316 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  59 
 
 
314 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  59.8 
 
 
309 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  60.75 
 
 
304 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  60.75 
 
 
304 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  59.8 
 
 
747 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  59.39 
 
 
304 aa  329  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  42.21 
 
 
303 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  47.62 
 
 
322 aa  231  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  42.47 
 
 
310 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  44.14 
 
 
298 aa  229  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  49.57 
 
 
308 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  45.17 
 
 
299 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 
316 aa  225  8e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  41.41 
 
 
310 aa  225  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  40.74 
 
 
303 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.33 
 
 
331 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  40.47 
 
 
327 aa  223  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  45.02 
 
 
301 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  45.73 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  42.03 
 
 
310 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  43.14 
 
 
301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
304 aa  218  8.999999999999998e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  45.55 
 
 
301 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  39.33 
 
 
316 aa  209  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  38.96 
 
 
348 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  39.23 
 
 
344 aa  209  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  38.11 
 
 
348 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.08 
 
 
332 aa  209  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  38.49 
 
 
348 aa  209  7e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  45.61 
 
 
304 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  43.3 
 
 
301 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  45.27 
 
 
304 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.46 
 
 
309 aa  202  7e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  38.16 
 
 
325 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  39.5 
 
 
302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  44.93 
 
 
327 aa  195  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  40.54 
 
 
305 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  38.13 
 
 
309 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  38 
 
 
337 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  38.54 
 
 
310 aa  189  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  38.31 
 
 
301 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  36.39 
 
 
316 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  37.29 
 
 
303 aa  187  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  45.98 
 
 
311 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  43.58 
 
 
300 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  34.87 
 
 
318 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 
302 aa  186  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  45.33 
 
 
345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  37.24 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  35.22 
 
 
309 aa  182  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  38.76 
 
 
345 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
305 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  42.67 
 
 
310 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  36.42 
 
 
335 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  38.61 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  36.09 
 
 
310 aa  179  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  36.72 
 
 
310 aa  178  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  37 
 
 
373 aa  177  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  34.9 
 
 
305 aa  176  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  38.13 
 
 
301 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  39.09 
 
 
316 aa  176  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  33.11 
 
 
308 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.48 
 
 
321 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  38.13 
 
 
304 aa  175  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  34.92 
 
 
311 aa  175  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  37.41 
 
 
302 aa  175  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  38 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  36.1 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  37.33 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  39.64 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  34.63 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  43.53 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  36.63 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  42.61 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  36.31 
 
 
304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 
359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  39.86 
 
 
326 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  37.86 
 
 
305 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  36.45 
 
 
319 aa  172  6.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  36.18 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 
300 aa  172  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  44.04 
 
 
242 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
304 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  35.49 
 
 
356 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  43.96 
 
 
318 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  33.77 
 
 
340 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.28 
 
 
342 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  35.53 
 
 
308 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  36.45 
 
 
316 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  43.96 
 
 
318 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  34.84 
 
 
300 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>