More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1426 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  100 
 
 
303 aa  619  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  63.61 
 
 
322 aa  391  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  64.85 
 
 
327 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  62.71 
 
 
304 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  51.19 
 
 
308 aa  293  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  50.33 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  48.47 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  42.72 
 
 
327 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  45.39 
 
 
310 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  41.08 
 
 
325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  45.61 
 
 
304 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  44.44 
 
 
304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  43.04 
 
 
303 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  44.48 
 
 
301 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 
331 aa  236  5.0000000000000005e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  40.2 
 
 
310 aa  235  6e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  40.2 
 
 
310 aa  235  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  40.54 
 
 
302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  42.47 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
316 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  40.07 
 
 
301 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  42.52 
 
 
309 aa  231  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  42.31 
 
 
300 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  41.24 
 
 
301 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  40.2 
 
 
298 aa  228  7e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  40.98 
 
 
301 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  39.13 
 
 
318 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  40 
 
 
302 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 
316 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  42.12 
 
 
302 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  40.74 
 
 
313 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  40.66 
 
 
306 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  41.14 
 
 
318 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  41.14 
 
 
318 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.74 
 
 
304 aa  222  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  38.41 
 
 
338 aa  222  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  42.27 
 
 
348 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  41.92 
 
 
348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  41.92 
 
 
348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  38.56 
 
 
314 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.16 
 
 
332 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  40.14 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  39.2 
 
 
303 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 
304 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  43.31 
 
 
309 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 
304 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  38.56 
 
 
747 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  41.41 
 
 
345 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  39.74 
 
 
345 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  35.48 
 
 
316 aa  185  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  34.52 
 
 
337 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  40 
 
 
309 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  33.87 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  34.52 
 
 
302 aa  178  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  35.08 
 
 
309 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  42.24 
 
 
326 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  40.43 
 
 
318 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
310 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  39.3 
 
 
318 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  39.3 
 
 
318 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  41.01 
 
 
304 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  37.27 
 
 
310 aa  169  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  41.44 
 
 
309 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  34.55 
 
 
315 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  41.35 
 
 
292 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  35.06 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  33.44 
 
 
308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  34.68 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  35.31 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  37.61 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  36.06 
 
 
305 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  32.89 
 
 
313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  35.96 
 
 
300 aa  162  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  35.74 
 
 
298 aa  162  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
302 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.05 
 
 
313 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  42.13 
 
 
310 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  40.53 
 
 
327 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  43.05 
 
 
325 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  36.43 
 
 
356 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  31.51 
 
 
309 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  32.69 
 
 
346 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  32.17 
 
 
373 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  39.53 
 
 
339 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  35.25 
 
 
303 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  37.16 
 
 
323 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0642  ABC transporter related  38.4 
 
 
297 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0145806  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  40.76 
 
 
250 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
310 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  34.67 
 
 
313 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  37.61 
 
 
335 aa  156  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.65 
 
 
302 aa  156  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  40.87 
 
 
326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  34.59 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  38.57 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 
310 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  38.7 
 
 
304 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  33.8 
 
 
303 aa  155  9e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  35.37 
 
 
308 aa  155  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>