More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1136 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  100 
 
 
310 aa  619  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  100 
 
 
310 aa  619  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  71.19 
 
 
338 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  65.52 
 
 
318 aa  402  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  64.35 
 
 
313 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.7 
 
 
316 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  65.46 
 
 
318 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  65.46 
 
 
318 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  59.33 
 
 
303 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  60.39 
 
 
314 aa  338  7e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  61.62 
 
 
304 aa  325  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 
309 aa  314  9e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 
304 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  60.61 
 
 
304 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  60.61 
 
 
747 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  44.37 
 
 
306 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  43.1 
 
 
298 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  40.2 
 
 
303 aa  235  7e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  41.55 
 
 
322 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 
316 aa  229  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  45.3 
 
 
310 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 
331 aa  228  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 
304 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  42.05 
 
 
310 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  44.3 
 
 
301 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  47.44 
 
 
308 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  40.2 
 
 
327 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  44.44 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  38.51 
 
 
303 aa  219  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  39.87 
 
 
344 aa  215  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  42.47 
 
 
301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  40.94 
 
 
299 aa  212  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  44.71 
 
 
304 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  44.71 
 
 
304 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  40.72 
 
 
345 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  40.78 
 
 
301 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  40.72 
 
 
345 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  39.46 
 
 
302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.94 
 
 
332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  37.87 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  41.31 
 
 
301 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  39.39 
 
 
309 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  37.54 
 
 
348 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  38.13 
 
 
348 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  37.16 
 
 
300 aa  192  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  36.69 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.88 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  39.93 
 
 
326 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
310 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  36.45 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  39.3 
 
 
305 aa  183  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  37.54 
 
 
301 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  36.15 
 
 
325 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.91 
 
 
305 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  37.46 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  38.24 
 
 
304 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  34.88 
 
 
304 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  35 
 
 
305 aa  178  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  39.44 
 
 
305 aa  178  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  42.49 
 
 
373 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  33.88 
 
 
318 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.13 
 
 
313 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  37.79 
 
 
305 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  34.97 
 
 
315 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 
305 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
305 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  36.16 
 
 
304 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 
356 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  36.6 
 
 
305 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  36.6 
 
 
305 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  40 
 
 
316 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  39.6 
 
 
350 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  37.58 
 
 
305 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  34.64 
 
 
340 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  36.09 
 
 
303 aa  176  6e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  37.2 
 
 
305 aa  175  8e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  37.37 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  33.44 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  44.07 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  35.28 
 
 
301 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  34.46 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  36.72 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.64 
 
 
309 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.64 
 
 
309 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.64 
 
 
309 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  40.42 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  36.27 
 
 
305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.31 
 
 
309 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
311 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  36.33 
 
 
334 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.41 
 
 
319 aa  172  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  35.33 
 
 
309 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  32.29 
 
 
327 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.79 
 
 
342 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  34.31 
 
 
300 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  34.31 
 
 
300 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  36.21 
 
 
335 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
369 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>