More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4469 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  100 
 
 		 302 aa  617  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  76.45 
 
 		 325 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  72.32 
 
 		 302 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  58.05 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  56.79 
 
 		 300 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  61.79 
 
 		 302 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  52.56 
 
 		 309 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  48.48 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 332 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  48.87 
 
 		 345 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  47.39 
 
 		 348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  49.67 
 
 		 345 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  47.88 
 
 		 348 aa  268  8e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  47.37 
 
 		 348 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  43 
 
 		 304 aa  246  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  44.33 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  40.54 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  42.23 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  40.73 
 
 		 308 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  41.89 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  41.25 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  41.22 
 
 		 304 aa  211  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  40 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.31 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  41.84 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.31 
 
 		 316 aa  208  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  38.62 
 
 		 310 aa  205  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  37.58 
 
 		 301 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  38.26 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  38.69 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  39.46 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  39.46 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  40.21 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  39.1 
 
 		 298 aa  198  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  38.54 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  39.06 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  39.5 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.09 
 
 		 304 aa  195  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 		 304 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.62 
 
 		 304 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  38.23 
 
 		 747 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  38.01 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  36.81 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  38.93 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  36.88 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  36.88 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  36.16 
 
 		 314 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.51 
 
 		 316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  39.46 
 
 		 316 aa  175  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  41.74 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  33.44 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  38.07 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.22 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  32.04 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  32.33 
 
 		 301 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.29 
 
 		 309 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  35.67 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  41.59 
 
 		 295 aa  159  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  40.72 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  37.72 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  40.72 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  31.27 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  30.48 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3152  ABC transporter related  32.47 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 247 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  38.52 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  38.39 
 
 		 313 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  41.59 
 
 		 250 aa  155  9e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  33 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  38.39 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  37.14 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  32.24 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  38.18 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  30.1 
 
 		 325 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  37.9 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.01 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  38.86 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  31.27 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  35.4 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  41.15 
 
 		 237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  32.11 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  32.11 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  32.65 
 
 		 282 aa  152  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  38.39 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.86 
 
 		 333 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  32.18 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  37.91 
 
 		 300 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  34.11 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  38.46 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.9 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  40.87 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  31.1 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  35.71 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  32.39 
 
 		 373 aa  151  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  34.98 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1021  ABC transporter related  39.07 
 
 		 237 aa  151  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00128788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.64 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>