More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1736 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  100 
 
 
304 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  97.7 
 
 
304 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  54.82 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  52.13 
 
 
308 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  49.67 
 
 
322 aa  291  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  50.17 
 
 
327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 
304 aa  280  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  44.44 
 
 
303 aa  259  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  54.61 
 
 
310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  49.14 
 
 
298 aa  248  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  47.99 
 
 
303 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  45.89 
 
 
348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  45.55 
 
 
348 aa  242  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  45.83 
 
 
348 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.97 
 
 
332 aa  236  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  45.08 
 
 
310 aa  234  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  43 
 
 
344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  48.81 
 
 
301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  44.91 
 
 
300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  48.29 
 
 
299 aa  232  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  41.64 
 
 
302 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  45.25 
 
 
316 aa  231  9e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  41.89 
 
 
302 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  40.13 
 
 
325 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 
304 aa  228  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  46.6 
 
 
304 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  46.44 
 
 
309 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  46.6 
 
 
304 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  45.45 
 
 
310 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  45.45 
 
 
310 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  45.61 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  46.28 
 
 
747 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  45.18 
 
 
306 aa  225  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  45.9 
 
 
338 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  40 
 
 
327 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.72 
 
 
316 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  45.1 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  45.26 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  46.46 
 
 
318 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  46.46 
 
 
318 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  44.55 
 
 
301 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  44.78 
 
 
301 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  44.44 
 
 
345 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  45.42 
 
 
301 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  44.1 
 
 
345 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  46.1 
 
 
314 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  37.95 
 
 
303 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  42.52 
 
 
309 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  43.09 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  39.81 
 
 
310 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  43.39 
 
 
310 aa  187  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  44.59 
 
 
316 aa  185  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  38.8 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  39.93 
 
 
308 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  45.53 
 
 
300 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  44.17 
 
 
292 aa  179  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  45.59 
 
 
318 aa  179  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  41.73 
 
 
332 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  40.6 
 
 
309 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  46.08 
 
 
318 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  45.1 
 
 
318 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  44.59 
 
 
300 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  39.8 
 
 
309 aa  175  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  35 
 
 
298 aa  175  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  40 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  36.49 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  46.26 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  42.28 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  43.95 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  42.73 
 
 
318 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  42.58 
 
 
347 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  45.07 
 
 
301 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  44.55 
 
 
316 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  38.16 
 
 
305 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  34.28 
 
 
310 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  34.33 
 
 
302 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  41.47 
 
 
313 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  43.29 
 
 
302 aa  169  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
390 aa  169  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  40.79 
 
 
367 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  38.78 
 
 
304 aa  169  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  47.73 
 
 
313 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  41.47 
 
 
313 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  41.01 
 
 
313 aa  167  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  40.14 
 
 
311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  40.17 
 
 
331 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1751  ABC transporter related  40.49 
 
 
302 aa  166  4e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  39.13 
 
 
306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  47.64 
 
 
332 aa  165  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  35.69 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.17 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  38.67 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  37.17 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  37 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  35.95 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  36.18 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  43.61 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  36.12 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  34.54 
 
 
298 aa  163  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>