More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1485 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  100 
 
 
332 aa  627  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  76.87 
 
 
342 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  46.75 
 
 
302 aa  258  8e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  45.93 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  47.25 
 
 
331 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1807  ABC transporter related  46.39 
 
 
303 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.83976 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  47.47 
 
 
305 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  46.71 
 
 
310 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  45.42 
 
 
310 aa  228  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  38.14 
 
 
300 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  43.81 
 
 
315 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  37.99 
 
 
326 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  43.22 
 
 
326 aa  196  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  43.43 
 
 
301 aa  195  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  49.56 
 
 
318 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  43.89 
 
 
339 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  39.25 
 
 
302 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  50.24 
 
 
318 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  49.76 
 
 
318 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  46.88 
 
 
309 aa  185  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  42.17 
 
 
311 aa  185  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  38.2 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  40.94 
 
 
310 aa  182  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  45.13 
 
 
301 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  41.95 
 
 
301 aa  182  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  46.53 
 
 
292 aa  182  9.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  48.15 
 
 
316 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  32.34 
 
 
308 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  36.27 
 
 
316 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.18 
 
 
312 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  45.41 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  41.78 
 
 
300 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  37.06 
 
 
326 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  45.02 
 
 
247 aa  179  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  40.2 
 
 
300 aa  178  9e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  49.32 
 
 
301 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  42.6 
 
 
313 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  38.19 
 
 
287 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  45.83 
 
 
308 aa  176  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  42.73 
 
 
313 aa  176  7e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  42.62 
 
 
304 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  47.09 
 
 
310 aa  175  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 
313 aa  175  9e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  40.41 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  36.63 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  36.59 
 
 
327 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  42.36 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  41.33 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0751  ABC transporter related  42.77 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  42.86 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  40.19 
 
 
367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  34.02 
 
 
303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  40.13 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  47.71 
 
 
298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 
310 aa  172  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  39.74 
 
 
457 aa  172  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  36.09 
 
 
305 aa  172  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  46.75 
 
 
337 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 
300 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  39.46 
 
 
305 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2233  ABC transporter related protein  41.41 
 
 
318 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0193643  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  34.13 
 
 
303 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  40.52 
 
 
318 aa  170  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  34.09 
 
 
305 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  43.69 
 
 
321 aa  170  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  41.4 
 
 
309 aa  170  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0521  ABC transporter related  37.11 
 
 
301 aa  169  4e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.342097  normal  0.0263898 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  45.5 
 
 
310 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
335 aa  169  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  47.73 
 
 
332 aa  169  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  48.64 
 
 
249 aa  169  8e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  47 
 
 
299 aa  169  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33.79 
 
 
303 aa  168  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  36.04 
 
 
305 aa  168  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  45.83 
 
 
316 aa  168  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  36.51 
 
 
355 aa  169  9e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  42.59 
 
 
315 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  35.41 
 
 
305 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  35.2 
 
 
320 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 
306 aa  167  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.24 
 
 
331 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4648  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  31.56 
 
 
307 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  35.55 
 
 
304 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  45.92 
 
 
322 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  41.14 
 
 
308 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  35.53 
 
 
306 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  44.19 
 
 
310 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.91 
 
 
331 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  32.91 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  43.42 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  34.01 
 
 
297 aa  166  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  34.59 
 
 
303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  35.29 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  45.93 
 
 
306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  38.91 
 
 
341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  44.07 
 
 
303 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  35.48 
 
 
303 aa  165  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4431  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  31.91 
 
 
307 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4774  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  31.91 
 
 
307 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  34.59 
 
 
303 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>