More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3196 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  100 
 
 		 298 aa  591  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  69.57 
 
 		 299 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  51.33 
 
 		 301 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  49.67 
 
 		 306 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  45.72 
 
 		 310 aa  251  9.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 		 316 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 		 331 aa  249  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  46.03 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  46.8 
 
 		 301 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  46.49 
 
 		 301 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  46.44 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  46.42 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  43.1 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  45.17 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  43.1 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  48.97 
 
 		 304 aa  235  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  41.45 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  49.14 
 
 		 304 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  42 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  44.14 
 
 		 313 aa  229  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  40.2 
 
 		 303 aa  228  7e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.78 
 
 		 316 aa  227  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  43.05 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  41.72 
 
 		 318 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  41.72 
 
 		 318 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  40.96 
 
 		 327 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.14 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  41.38 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  39.16 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.14 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.14 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  40.69 
 
 		 348 aa  205  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  38.13 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  42.76 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  40.69 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  41.36 
 
 		 747 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  40.69 
 
 		 348 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  39.1 
 
 		 302 aa  198  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  36.7 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  36.59 
 
 		 325 aa  192  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.54 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  40.4 
 
 		 345 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 309 aa  185  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  42.24 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  38.08 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  35.54 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  37.05 
 
 		 305 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  40.07 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  42.09 
 
 		 308 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  33.45 
 
 		 300 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  36.21 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  37.95 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  40.21 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  39.86 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  38.59 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  39.52 
 
 		 301 aa  175  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  37.86 
 
 		 310 aa  175  9e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  41.36 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  47.71 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  37.8 
 
 		 302 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  36.91 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  37.34 
 
 		 346 aa  172  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  40.89 
 
 		 313 aa  172  9e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  38.8 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  40.89 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  37.76 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  38.43 
 
 		 326 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  34.31 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  40.44 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  33.77 
 
 		 318 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 		 305 aa  168  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  34.9 
 
 		 298 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  37.92 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  38.26 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  42.24 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  40.67 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.82 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  47.2 
 
 		 342 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  37.41 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  42.73 
 
 		 318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  36.73 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  34.21 
 
 		 315 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.79 
 
 		 319 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  41.44 
 
 		 339 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  35.52 
 
 		 320 aa  165  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  35.43 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  35.83 
 
 		 304 aa  165  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  37.67 
 
 		 301 aa  165  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  42.27 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  42.27 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  35.02 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  33.01 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  34.75 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>