More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2142 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  100 
 
 		 247 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  63.75 
 
 		 247 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  55.92 
 
 		 287 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  51.8 
 
 		 288 aa  239  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  55.16 
 
 		 367 aa  237  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  52.04 
 
 		 287 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  50.42 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  49.56 
 
 		 326 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  48.72 
 
 		 325 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  51.38 
 
 		 309 aa  229  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  53.27 
 
 		 303 aa  228  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  46.7 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  51.6 
 
 		 318 aa  224  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  50.23 
 
 		 318 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  48.29 
 
 		 326 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  46.78 
 
 		 292 aa  217  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  49.33 
 
 		 339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  51.69 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3286  ABC transporter-like  48.28 
 
 		 330 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1062  ABC transporter-like protein protein  47.84 
 
 		 326 aa  211  7.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.124744  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 305 aa  206  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 310 aa  205  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  48.39 
 
 		 331 aa  196  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  45.02 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  44.21 
 
 		 310 aa  188  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  47.24 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  44.39 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  39.27 
 
 		 308 aa  185  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  47.55 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  45.59 
 
 		 313 aa  182  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  43.35 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  45.59 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  45.1 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1807  ABC transporter related  46.15 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.83976 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  43.41 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  44.39 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  44.65 
 
 		 342 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 332 aa  178  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  48.54 
 
 		 316 aa  178  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  43.81 
 
 		 305 aa  178  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  42.67 
 
 		 279 aa  178  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  44.5 
 
 		 311 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  44.1 
 
 		 309 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  45.5 
 
 		 303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  44.71 
 
 		 310 aa  171  9e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  41.95 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  48.24 
 
 		 318 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  43.13 
 
 		 356 aa  170  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  38.15 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  38.59 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  44.86 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  40.35 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 310 aa  168  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  46.23 
 
 		 316 aa  168  7e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  43.64 
 
 		 332 aa  168  8e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  35.77 
 
 		 253 aa  168  9e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 300 aa  167  1e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  43.48 
 
 		 308 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  47.45 
 
 		 346 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.89 
 
 		 320 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  40.98 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  44.08 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  43.61 
 
 		 373 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  42.38 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  40.98 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  39.91 
 
 		 320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  43.29 
 
 		 334 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  41.15 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  37.6 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  40.32 
 
 		 331 aa  165  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  40.29 
 
 		 337 aa  165  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  37.8 
 
 		 241 aa  164  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 304 aa  164  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  40.86 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  38.98 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2035  ABC transporter, ATP-binding protein  40.81 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0885424  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  41.26 
 
 		 293 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  40 
 
 		 241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  42.79 
 
 		 310 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  37.65 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  43.54 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  43.96 
 
 		 301 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  44.04 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  43.95 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  43.95 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  45.63 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  41.2 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  45.63 
 
 		 320 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  41.83 
 
 		 310 aa  161  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  38.26 
 
 		 303 aa  162  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 335 aa  162  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  40.33 
 
 		 249 aa  161  7e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  45.13 
 
 		 312 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  38.21 
 
 		 241 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>