More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0381 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  100 
 
 
331 aa  643    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  60.8 
 
 
302 aa  344  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  54.75 
 
 
310 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  51.49 
 
 
305 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  53.97 
 
 
310 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  47.9 
 
 
305 aa  262  6.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  43 
 
 
300 aa  255  7e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  44.79 
 
 
315 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1807  ABC transporter related  45.72 
 
 
303 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.83976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  56.7 
 
 
332 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  46.51 
 
 
342 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  39.75 
 
 
292 aa  211  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  41.53 
 
 
316 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  40.97 
 
 
302 aa  208  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  40 
 
 
325 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  38.51 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  44.93 
 
 
326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  36.74 
 
 
313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  40.47 
 
 
301 aa  200  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  36.42 
 
 
313 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  36.42 
 
 
313 aa  199  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  42.01 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  48.39 
 
 
247 aa  196  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  45.74 
 
 
337 aa  195  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  40.07 
 
 
316 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  39.02 
 
 
296 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  37.25 
 
 
287 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  37.06 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  37.69 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  44.54 
 
 
327 aa  189  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  47.51 
 
 
320 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  43.04 
 
 
318 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  43.46 
 
 
318 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3286  ABC transporter-like  41.29 
 
 
330 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  43.88 
 
 
318 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  42.57 
 
 
301 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  41.95 
 
 
326 aa  186  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  40.13 
 
 
309 aa  186  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  36.7 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  37.58 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  35.28 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  47.39 
 
 
300 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  40.99 
 
 
319 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  47.49 
 
 
301 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  36.72 
 
 
287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  46.61 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  36.66 
 
 
318 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 
301 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  40.33 
 
 
310 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  43.89 
 
 
298 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
311 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  39.81 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  37.3 
 
 
304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  37.46 
 
 
288 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  39.56 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  44.95 
 
 
279 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.89 
 
 
312 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  41.74 
 
 
257 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  36.71 
 
 
356 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2734  ABC transporter related  33.89 
 
 
341 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  35.8 
 
 
328 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.06 
 
 
316 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  37.79 
 
 
302 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  32.36 
 
 
312 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  37.79 
 
 
302 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  32.36 
 
 
312 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  32.36 
 
 
312 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  32.36 
 
 
312 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  32.36 
 
 
312 aa  175  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  32.36 
 
 
312 aa  175  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  32.36 
 
 
312 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  32.36 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5742  ABC transporter related protein  38.31 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  32.04 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  32.04 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  47.53 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  40 
 
 
328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  31.25 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.57 
 
 
339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  39.22 
 
 
305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  43.58 
 
 
236 aa  172  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  38.46 
 
 
303 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
305 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  43 
 
 
247 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  43.17 
 
 
304 aa  172  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  44.12 
 
 
332 aa  172  9e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  31.92 
 
 
312 aa  172  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  42.6 
 
 
314 aa  172  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  33.44 
 
 
310 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  39.68 
 
 
311 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  36.74 
 
 
346 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 
306 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  37.87 
 
 
303 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  40.26 
 
 
346 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  41.82 
 
 
305 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  39.09 
 
 
318 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  39.09 
 
 
318 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  37.16 
 
 
308 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>