More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1536 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  100 
 
 		 305 aa  618  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  57.84 
 
 		 303 aa  350  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  48.36 
 
 		 298 aa  277  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  56.59 
 
 		 300 aa  251  9.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2035  ABC transporter, ATP-binding protein  43.95 
 
 		 300 aa  249  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0885424  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  41.94 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  41.29 
 
 		 313 aa  246  4e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  40.97 
 
 		 313 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  41.29 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  38.41 
 
 		 308 aa  212  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  36.96 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  36.96 
 
 		 301 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  36.22 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  43.52 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  38.11 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  36.3 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  36.3 
 
 		 302 aa  189  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  34.65 
 
 		 313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.04 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  42.54 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  43.41 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  38.37 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.04 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  35.71 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.39 
 
 		 309 aa  178  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  44.44 
 
 		 327 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  38.84 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  34.08 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  44.33 
 
 		 318 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  41.05 
 
 		 287 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  34.26 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  44.33 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  34.54 
 
 		 307 aa  175  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  41.78 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  42.86 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  44.12 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  34.74 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  39.59 
 
 		 244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  40.91 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2348  ABC transporter related  38.13 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  33.55 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  40.09 
 
 		 331 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 303 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  37.5 
 
 		 292 aa  172  6.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  35.05 
 
 		 328 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  40.27 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  39.02 
 
 		 244 aa  172  9e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  40.09 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  39.11 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  37.19 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  34.87 
 
 		 311 aa  170  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  39.43 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  37.55 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  44 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  33.44 
 
 		 305 aa  169  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  42.17 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  36.95 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  38.36 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  36.01 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  33.23 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  33.02 
 
 		 321 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  35.25 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  36.9 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  40.27 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  35.41 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  41.67 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  36.99 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  38.64 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  33.44 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  32.79 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  33.97 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  38.18 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  40 
 
 		 300 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  32.91 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  36.12 
 
 		 317 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.69 
 
 		 293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  36.63 
 
 		 328 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  37.02 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 300 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 300 aa  165  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  33.99 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  31.67 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  40.09 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  36.43 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  37.27 
 
 		 236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  35.81 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>