More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2113 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  100 
 
 		 303 aa  621  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  57.84 
 
 		 305 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2035  ABC transporter, ATP-binding protein  43.87 
 
 		 300 aa  251  8.000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0885424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  44.48 
 
 		 298 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  45.76 
 
 		 313 aa  229  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  45.76 
 
 		 313 aa  228  8e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  39.74 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  38.91 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  36.09 
 
 		 313 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  35.47 
 
 		 302 aa  186  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  37.42 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  43.63 
 
 		 339 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.05 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  35.43 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.05 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  42.48 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  42.48 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  36.39 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  40.69 
 
 		 340 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  45.36 
 
 		 367 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  41.9 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  41.59 
 
 		 309 aa  175  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  36.51 
 
 		 307 aa  175  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  34.44 
 
 		 304 aa  175  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  41.71 
 
 		 305 aa  175  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  42.65 
 
 		 318 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  34.21 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  34.21 
 
 		 302 aa  175  9e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  35.12 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  40.85 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  34.21 
 
 		 301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  42.16 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  41.3 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  33.45 
 
 		 295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  41.96 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  41.28 
 
 		 328 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  31.83 
 
 		 310 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  42.65 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  40.45 
 
 		 315 aa  172  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.9 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  39.73 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  38.26 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  38.13 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  39.81 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  34.87 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  37.61 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  37.39 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  38.57 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  34.44 
 
 		 350 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  37.84 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.13 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  34.25 
 
 		 287 aa  169  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0156  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  39.13 
 
 		 254 aa  168  9e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  33.33 
 
 		 320 aa  168  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 309 aa  168  9e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  33.57 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  38.39 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  39.21 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2202  ABC transporter related protein  33.92 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817339 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  39.48 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  34.56 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  35.27 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.61 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  34.21 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 303 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  37.27 
 
 		 299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  38.97 
 
 		 316 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  36.55 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  32.35 
 
 		 302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  34.22 
 
 		 307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  31.88 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.01 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  36.49 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.88 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  33.55 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  31.88 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  38.27 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  37.73 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  31.88 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  31.54 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  31.88 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  35.05 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  33.22 
 
 		 300 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2001  ABC transporter related  39.23 
 
 		 418 aa  163  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.985139  hitchhiker  0.00587688 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  36.36 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  32.89 
 
 		 300 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  32.89 
 
 		 300 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  38.06 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 		 300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  38.46 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  38.14 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  38.36 
 
 		 318 aa  162  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  39.72 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>