More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2675 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  100 
 
 
247 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  63.75 
 
 
247 aa  320  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  54.51 
 
 
288 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  54.04 
 
 
304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  55.92 
 
 
303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  51.77 
 
 
287 aa  239  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  52.65 
 
 
287 aa  237  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  51.82 
 
 
367 aa  229  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  49.55 
 
 
318 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  50.88 
 
 
296 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  49.76 
 
 
309 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 
318 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  50.68 
 
 
318 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  49.55 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  48.46 
 
 
326 aa  214  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
310 aa  204  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  44.4 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  49.06 
 
 
305 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  44.95 
 
 
326 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  46.61 
 
 
325 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  45.1 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1062  ABC transporter-like protein protein  46.73 
 
 
326 aa  183  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.124744  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  46.43 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  39.3 
 
 
292 aa  181  9.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 
300 aa  178  7e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  42.23 
 
 
300 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3286  ABC transporter-like  46.26 
 
 
330 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  46.32 
 
 
315 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  47.34 
 
 
298 aa  176  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  44.28 
 
 
310 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  43.9 
 
 
305 aa  175  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
305 aa  174  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  43.81 
 
 
313 aa  174  9e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
313 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  41.3 
 
 
303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  43.33 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  41.94 
 
 
308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  43 
 
 
331 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  41.43 
 
 
305 aa  172  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  39.91 
 
 
390 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1807  ABC transporter related  43.48 
 
 
303 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.83976 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  40.91 
 
 
279 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  40.54 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2035  ABC transporter, ATP-binding protein  44.08 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0885424  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  41.23 
 
 
327 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  43.06 
 
 
311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  43.67 
 
 
332 aa  166  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
297 aa  165  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  40.62 
 
 
313 aa  165  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
297 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  40 
 
 
297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  46.3 
 
 
309 aa  165  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  40.57 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  43.06 
 
 
320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  41.33 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  40.18 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 
297 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  42.04 
 
 
316 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 
297 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 
297 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 
297 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  40.53 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 
297 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  40.74 
 
 
373 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  43.78 
 
 
303 aa  163  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  40 
 
 
314 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  42.06 
 
 
310 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 
302 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 
302 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  38.68 
 
 
291 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  43.59 
 
 
310 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  42.58 
 
 
356 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  44.83 
 
 
316 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  44.14 
 
 
242 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  43.69 
 
 
270 aa  160  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  34.94 
 
 
274 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  41.67 
 
 
319 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  43.17 
 
 
305 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  40.78 
 
 
328 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  42.44 
 
 
303 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  36.59 
 
 
300 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 
301 aa  159  5e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  42.49 
 
 
304 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  36.69 
 
 
301 aa  159  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 
301 aa  158  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  39.3 
 
 
310 aa  158  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2058  ABC transporter, ATPase subunit  37.2 
 
 
291 aa  158  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0074  ABC transporter related protein  41.26 
 
 
309 aa  158  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  38.5 
 
 
350 aa  158  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 
301 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  37.08 
 
 
242 aa  158  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.96 
 
 
321 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  43.84 
 
 
346 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  35.59 
 
 
327 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  39.81 
 
 
257 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  41.28 
 
 
250 aa  157  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  36.78 
 
 
245 aa  156  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  40.95 
 
 
339 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>