More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1137 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 301 aa  617  1e-176  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  72.76 
 
 		 306 aa  390  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  60.57 
 
 		 276 aa  315  7e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.11 
 
 		 295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  58.47 
 
 		 272 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 279 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  57.66 
 
 		 268 aa  302  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2751  ABC transporter related  55.97 
 
 		 249 aa  289  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.33 
 
 		 274 aa  289  4e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.905308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  53.63 
 
 		 254 aa  271  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  53.2 
 
 		 254 aa  271  8.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.23 
 
 		 256 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.6 
 
 		 293 aa  261  6.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  51.27 
 
 		 259 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  50.43 
 
 		 261 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3072  ABC transporter related protein  48.99 
 
 		 254 aa  248  8e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2589  ATP-binding transport protein NatA  52.34 
 
 		 266 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.408024  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  49.8 
 
 		 252 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  45.6 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  44.4 
 
 		 255 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  42.19 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3107  ABC transporter related  49.79 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000121464  hitchhiker  0.00525293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  42.57 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  43.05 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  37.01 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  39.24 
 
 		 242 aa  181  9.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.01 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  38.49 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  38.1 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.66 
 
 		 249 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 		 321 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  37.61 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.45 
 
 		 342 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  39.92 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.01 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.55 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  39.43 
 
 		 249 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  36.97 
 
 		 241 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  36.97 
 
 		 241 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 241 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 241 aa  175  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  37.89 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.18 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.82 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  37.44 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 		 244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  39.09 
 
 		 337 aa  173  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  38.89 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.45 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  35.86 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  36.84 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  37.34 
 
 		 247 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  38.46 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  36.36 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.09 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.36 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  33.61 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.07 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  36.48 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  37.82 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  40.59 
 
 		 253 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  35.98 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  35.95 
 
 		 414 aa  168  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.01 
 
 		 345 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.18 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  35.9 
 
 		 247 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1289  ABC transporter related  35.62 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.077287  hitchhiker  0.00948798 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4937  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.6 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.691547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  38.66 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  35.62 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.21 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0867076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  36.52 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  37.04 
 
 		 250 aa  166  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.09 
 
 		 446 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39000  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.55 
 
 		 322 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447872 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  35.29 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  36.36 
 
 		 328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  35.71 
 
 		 241 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  38.43 
 
 		 305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  35.32 
 
 		 250 aa  166  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  35.45 
 
 		 319 aa  165  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  37.02 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  34.54 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  36.91 
 
 		 250 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  34.54 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  36.91 
 
 		 250 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  37.61 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  34.86 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.05 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.07 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.85 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  35.04 
 
 		 243 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  38.81 
 
 		 258 aa  163  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>