More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0134 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  495  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  495  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  69.2 
 
 		 246 aa  344  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  66.8 
 
 		 247 aa  338  4e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  63.2 
 
 		 249 aa  331  8e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  49 
 
 		 259 aa  243  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  47.97 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 253 aa  231  6e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  46.8 
 
 		 257 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  46.96 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 		 259 aa  224  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  49.39 
 
 		 256 aa  218  7.999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  42.92 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 241 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  45.19 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  44.84 
 
 		 241 aa  214  8e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  44.58 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  46.22 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  41.42 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  44.44 
 
 		 240 aa  206  4e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  42.32 
 
 		 241 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 241 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  42.32 
 
 		 241 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  44.1 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  42.08 
 
 		 279 aa  202  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  41.08 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  42.92 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  43.18 
 
 		 312 aa  197  9e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  40.76 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  41.98 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  42.36 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  40.53 
 
 		 316 aa  195  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  39.75 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  39.52 
 
 		 247 aa  195  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 		 238 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  40.72 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  40.5 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  44.07 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  44.07 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  42.99 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.57 
 
 		 309 aa  193  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  42.08 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  46.22 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  42.53 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  39.68 
 
 		 337 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.44 
 
 		 243 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 313 aa  188  8e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  43.05 
 
 		 301 aa  188  8e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  40.79 
 
 		 327 aa  187  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  38.49 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  41.77 
 
 		 250 aa  186  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  42.5 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  36.26 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.35 
 
 		 279 aa  185  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  39.27 
 
 		 414 aa  185  8e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  40.5 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  43.05 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  39.73 
 
 		 316 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  39.24 
 
 		 541 aa  183  3e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  41.74 
 
 		 512 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  37.71 
 
 		 240 aa  182  6e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 272 aa  182  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  37.01 
 
 		 274 aa  181  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  38.55 
 
 		 576 aa  181  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  41.15 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  36.78 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.29 
 
 		 333 aa  180  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  41.55 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  37.5 
 
 		 578 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 578 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  37.5 
 
 		 578 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 578 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 578 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 578 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  37.5 
 
 		 578 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  39.45 
 
 		 315 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 578 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 578 aa  179  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 		 312 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 		 312 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  40.99 
 
 		 334 aa  178  5.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 		 312 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 		 312 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>