More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2672 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  100 
 
 
300 aa  614  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  45.39 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  45.26 
 
 
298 aa  278  9e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  43 
 
 
298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  42.81 
 
 
308 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  44.97 
 
 
309 aa  247  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  40.69 
 
 
305 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  39.19 
 
 
299 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  37.12 
 
 
304 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  36.93 
 
 
321 aa  228  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  37.22 
 
 
309 aa  227  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  43.05 
 
 
315 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  38.44 
 
 
299 aa  225  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  38.38 
 
 
299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  38.38 
 
 
299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  38.54 
 
 
305 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  39.8 
 
 
319 aa  216  5e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  37.58 
 
 
315 aa  216  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  39.58 
 
 
294 aa  215  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  37.67 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  39.04 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  37.7 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.97 
 
 
309 aa  211  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
301 aa  208  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
309 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.43 
 
 
309 aa  206  4e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 
294 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  36.95 
 
 
406 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  34.49 
 
 
296 aa  198  9e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.56 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  36.27 
 
 
292 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 
296 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  37.71 
 
 
293 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  36.55 
 
 
316 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.97 
 
 
326 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  33.9 
 
 
294 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  33.9 
 
 
294 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  33.56 
 
 
303 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.71 
 
 
297 aa  191  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  36.51 
 
 
318 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.9 
 
 
291 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  33.9 
 
 
294 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  36.15 
 
 
307 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  37 
 
 
326 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  33.56 
 
 
303 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  33.22 
 
 
294 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  32.88 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  32.88 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  36.33 
 
 
318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  32.88 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  32.88 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  32.88 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  35.31 
 
 
303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  35.59 
 
 
295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  36.45 
 
 
317 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  32.99 
 
 
296 aa  180  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  32.2 
 
 
306 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  34.68 
 
 
294 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  34.25 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  36.15 
 
 
290 aa  178  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  34.46 
 
 
292 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  34.68 
 
 
297 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  40.47 
 
 
329 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  35.57 
 
 
298 aa  176  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  33.56 
 
 
316 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  35.23 
 
 
341 aa  175  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  35.2 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  32 
 
 
309 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  32.89 
 
 
303 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  31.56 
 
 
293 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  32.09 
 
 
298 aa  169  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  32.67 
 
 
337 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  32.35 
 
 
341 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  37.55 
 
 
334 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  32.34 
 
 
316 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  36.44 
 
 
326 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  32.24 
 
 
295 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  33.77 
 
 
293 aa  166  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  32.79 
 
 
258 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  31.88 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  34.54 
 
 
301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  29.72 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  33.55 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  33.57 
 
 
326 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  33.11 
 
 
338 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  35.81 
 
 
303 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  30.79 
 
 
303 aa  162  6e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  31.8 
 
 
308 aa  162  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  34.56 
 
 
310 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  30.49 
 
 
312 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  34.8 
 
 
251 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  29.93 
 
 
339 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  29.93 
 
 
339 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  31.06 
 
 
287 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  30.26 
 
 
310 aa  159  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  35.4 
 
 
237 aa  158  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  34.55 
 
 
306 aa  158  8e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  33.33 
 
 
313 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  32.44 
 
 
305 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>