More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1289 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1289  ABC transporter related  100 
 
 
242 aa  500  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.077287  hitchhiker  0.00948798 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1457  ABC transporter related  73.11 
 
 
241 aa  368  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0710  ABC transporter related  68.49 
 
 
239 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1004  ABC transporter related  67.23 
 
 
237 aa  351  7e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00470286 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  66.09 
 
 
238 aa  333  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2857  ABC transporter, ATP-binding protein  59.07 
 
 
247 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00741343  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0352  ABC transporter related  48.95 
 
 
260 aa  238  9e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2701  ABC transporter related  51.11 
 
 
241 aa  237  1e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.128649  normal  0.0320572 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5208  ABC transporter related protein  47.52 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3071  ABC transporter related protein  46.58 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0830  ABC transporter related protein  48.24 
 
 
226 aa  199  5e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  36.67 
 
 
247 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  38.06 
 
 
259 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  37.5 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  39.91 
 
 
328 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  36.32 
 
 
246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  39.57 
 
 
279 aa  169  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  37.08 
 
 
259 aa  168  8e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.53 
 
 
256 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 
301 aa  167  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  35.86 
 
 
253 aa  164  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  36.84 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  34.68 
 
 
282 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  37.5 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  37.67 
 
 
339 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  37.5 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.53 
 
 
279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  36.84 
 
 
293 aa  162  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.85 
 
 
329 aa  161  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  34.76 
 
 
245 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  38.08 
 
 
253 aa  160  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  35.89 
 
 
250 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  38.43 
 
 
254 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  42.74 
 
 
270 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.12 
 
 
316 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  34.84 
 
 
246 aa  159  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  36.36 
 
 
247 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
305 aa  158  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  38.11 
 
 
261 aa  158  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.95 
 
 
339 aa  158  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.09 
 
 
295 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  37.33 
 
 
322 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  34.93 
 
 
276 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  35.59 
 
 
249 aa  157  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  36.07 
 
 
287 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  37.29 
 
 
259 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.07 
 
 
328 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  36.36 
 
 
332 aa  156  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  35.77 
 
 
252 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  39.17 
 
 
316 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  35.81 
 
 
261 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  35.16 
 
 
319 aa  156  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  35.4 
 
 
319 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.7 
 
 
328 aa  156  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.1 
 
 
325 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  35.62 
 
 
327 aa  155  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  34.33 
 
 
306 aa  154  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  36.94 
 
 
369 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  31.09 
 
 
250 aa  153  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  35.95 
 
 
257 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  36.86 
 
 
240 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  35.06 
 
 
310 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  36.89 
 
 
287 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
335 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.56 
 
 
324 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.99 
 
 
334 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.11 
 
 
326 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  36.55 
 
 
254 aa  153  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.49 
 
 
328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  34.22 
 
 
326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  36.32 
 
 
337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  33.91 
 
 
279 aa  152  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  35.43 
 
 
289 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  33.77 
 
 
320 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  36.24 
 
 
308 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  34.89 
 
 
325 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  34.58 
 
 
251 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  36.29 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  37.24 
 
 
275 aa  151  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  36.16 
 
 
303 aa  151  8.999999999999999e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  37 
 
 
316 aa  151  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  36.87 
 
 
240 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  36.59 
 
 
272 aa  150  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 
242 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.71 
 
 
309 aa  150  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  33.47 
 
 
291 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  37.04 
 
 
332 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
318 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.71 
 
 
308 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  34.82 
 
 
312 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3107  ABC transporter related  36.68 
 
 
297 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000121464  hitchhiker  0.00525293 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  37.56 
 
 
249 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 
241 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  32.79 
 
 
321 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  36.87 
 
 
303 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  37.5 
 
 
250 aa  149  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  33.62 
 
 
272 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  36.79 
 
 
287 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  35.47 
 
 
255 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.86 
 
 
305 aa  149  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>