More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4500 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  93.31 
 
 		 254 aa  462  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  66.12 
 
 		 279 aa  320  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  67.89 
 
 		 276 aa  318  7e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.78 
 
 		 295 aa  315  5e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  65.59 
 
 		 272 aa  314  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  66.53 
 
 		 268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  63.24 
 
 		 256 aa  302  3.0000000000000004e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.14 
 
 		 293 aa  296  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  61.79 
 
 		 274 aa  295  6e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.905308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2751  ABC transporter related  63.27 
 
 		 249 aa  295  6e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  62.5 
 
 		 252 aa  289  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2589  ATP-binding transport protein NatA  61.94 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.408024  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  56.5 
 
 		 306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3072  ABC transporter related protein  59.29 
 
 		 254 aa  279  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  57.87 
 
 		 259 aa  273  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  59.92 
 
 		 257 aa  271  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  53.63 
 
 		 301 aa  271  5.000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  54.88 
 
 		 261 aa  265  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3107  ABC transporter related  59.92 
 
 		 297 aa  251  7e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000121464  hitchhiker  0.00525293 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  48.25 
 
 		 259 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  52.4 
 
 		 253 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  52.19 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  52.19 
 
 		 255 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  44.98 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.44 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.61 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  40.18 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  32.4 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  38.43 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  34.57 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  44.17 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  35.48 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  40.09 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  39.84 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  36.78 
 
 		 251 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  33.62 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  41.84 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  38.68 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  40.99 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  40.44 
 
 		 328 aa  164  9e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  36.91 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  32.63 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  41.44 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  42.73 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  35.77 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  37.95 
 
 		 305 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  37.44 
 
 		 327 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  34.84 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  37.71 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  36 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  38.14 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  40 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  36 
 
 		 241 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 244 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  35.11 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  35.11 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  40.43 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0710  ABC transporter related  37.72 
 
 		 239 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  36.96 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.15 
 
 		 345 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  37.4 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  33.73 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  33.73 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  36.44 
 
 		 241 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  39.27 
 
 		 249 aa  158  6e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  34.16 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  37.86 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.13 
 
 		 331 aa  158  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  38.36 
 
 		 247 aa  158  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  39.91 
 
 		 325 aa  158  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  37.23 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  39.46 
 
 		 332 aa  157  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  40.45 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  38.03 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  37.71 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  36.09 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  39.35 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  37.61 
 
 		 310 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.13 
 
 		 330 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  38.79 
 
 		 301 aa  155  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  34.6 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  37.05 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  37.29 
 
 		 244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 		 356 aa  155  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 311 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  39.09 
 
 		 304 aa  155  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  37.9 
 
 		 310 aa  154  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.89 
 
 		 321 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  36.86 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  32.27 
 
 		 312 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  38.31 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>