More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0297 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  100 
 
 		 241 aa  487  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  98.76 
 
 		 241 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  67.63 
 
 		 241 aa  340  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  67.63 
 
 		 241 aa  340  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  67.63 
 
 		 241 aa  340  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  67.63 
 
 		 241 aa  340  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  67.63 
 
 		 241 aa  340  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  67.63 
 
 		 241 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  67.63 
 
 		 241 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  65.56 
 
 		 241 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  66.39 
 
 		 241 aa  333  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  65.98 
 
 		 244 aa  331  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  65.56 
 
 		 241 aa  330  1e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  62.66 
 
 		 242 aa  322  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  52.48 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  55.6 
 
 		 239 aa  271  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  50.62 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.26 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  49.38 
 
 		 237 aa  259  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  51.68 
 
 		 244 aa  254  7e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  47.28 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  48.54 
 
 		 236 aa  244  8e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 		 243 aa  234  9e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  46.06 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  44.81 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  45.31 
 
 		 259 aa  228  8e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  44.58 
 
 		 247 aa  225  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  40.83 
 
 		 247 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  44.84 
 
 		 250 aa  214  8e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  45.8 
 
 		 249 aa  214  8e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  44.84 
 
 		 250 aa  214  8e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  43.72 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  44.63 
 
 		 247 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 250 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  45.33 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1742  ABC transporter-related protein  41.08 
 
 		 238 aa  208  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.6629  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  38.84 
 
 		 245 aa  207  9e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  41.28 
 
 		 414 aa  205  5e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  40.25 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  39.42 
 
 		 253 aa  198  6e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  41.33 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  38.59 
 
 		 253 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.17 
 
 		 312 aa  185  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  37.89 
 
 		 325 aa  182  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.28 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.63 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.01 
 
 		 321 aa  178  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  37.24 
 
 		 279 aa  178  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.25 
 
 		 312 aa  178  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  40.43 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.39 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  36.82 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  39.56 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  39.46 
 
 		 309 aa  175  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  35.86 
 
 		 305 aa  175  5e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  33.61 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.73 
 
 		 309 aa  174  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 309 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  34.96 
 
 		 337 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  37.39 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  35.9 
 
 		 328 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 		 356 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  34.18 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  37.72 
 
 		 303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  33.63 
 
 		 316 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  39.17 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  36.68 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.91 
 
 		 319 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  36.04 
 
 		 314 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  38.35 
 
 		 304 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 		 305 aa  171  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 301 aa  171  7.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  37.39 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  37.39 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  35.59 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  36.4 
 
 		 337 aa  170  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  36.4 
 
 		 337 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  34.18 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 369 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.7 
 
 		 305 aa  168  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  41.75 
 
 		 318 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  33.78 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  36.24 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  37.24 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  33.33 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  35.66 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  34.09 
 
 		 328 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  40.87 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  38.5 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1367  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  37.89 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0150774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  38.84 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.27 
 
 		 318 aa  166  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  32.49 
 
 		 272 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  36.2 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  38.08 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  39.51 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>