More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3008 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  69.36 
 
 		 237 aa  354  7.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  68.35 
 
 		 238 aa  337  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  67.93 
 
 		 243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  67.93 
 
 		 238 aa  334  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  56.78 
 
 		 247 aa  294  7e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  57.51 
 
 		 414 aa  284  8e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  50.63 
 
 		 239 aa  249  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  48.96 
 
 		 252 aa  246  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  47.08 
 
 		 240 aa  245  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 		 241 aa  244  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 		 241 aa  244  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  48.54 
 
 		 241 aa  244  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 		 241 aa  244  8e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  48.1 
 
 		 241 aa  244  9e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  48.1 
 
 		 241 aa  244  9e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 		 241 aa  244  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  48.1 
 
 		 241 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 		 244 aa  241  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  47.68 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  46.84 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  46.22 
 
 		 250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1742  ABC transporter-related protein  47.83 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.6629  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  43.81 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  43.48 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.41 
 
 		 243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  42.36 
 
 		 250 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  42.36 
 
 		 250 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  42.44 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  43.05 
 
 		 247 aa  191  7e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  39.33 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  39.83 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  37.24 
 
 		 247 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.82 
 
 		 249 aa  185  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  40.43 
 
 		 246 aa  184  9e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  40.33 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  36.82 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  36.91 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  37.34 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  38.75 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  38.33 
 
 		 255 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  36.48 
 
 		 253 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  35.42 
 
 		 246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 250 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  36.96 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  36.89 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 		 301 aa  169  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  37.27 
 
 		 301 aa  169  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  34.76 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  34.68 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  38.81 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  39.5 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 256 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  36.02 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  37.96 
 
 		 256 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  36.44 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  35.22 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  34.55 
 
 		 305 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.04 
 
 		 326 aa  164  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  37.39 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  39.67 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  38.75 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.7 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  36.91 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 306 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  36.51 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  32.89 
 
 		 293 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 		 306 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 		 241 aa  162  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  38.33 
 
 		 243 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  37.96 
 
 		 369 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 266 aa  162  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  36.06 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  36.07 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  37.17 
 
 		 243 aa  162  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  36.36 
 
 		 304 aa  161  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  36.21 
 
 		 253 aa  161  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0963  ABC transporter related  34.44 
 
 		 247 aa  161  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  36.97 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2751  ABC transporter related  32.6 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1213  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  34.02 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  33.48 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0815  ABC transporter-related protein  34.85 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  35.14 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3072  ABC transporter related protein  35.4 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  34.13 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1152  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  34.02 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0968  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0645  ABC transporter related  37.18 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1084  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  34.02 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  34.84 
 
 		 306 aa  159  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  38.46 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0979  ABC transporter ATP-binding protein EcsA  34.02 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1048  ABC transporter ATP-binding protein  34.02 
 
 		 247 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.91 
 
 		 312 aa  158  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0958  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 247 aa  158  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>