More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7157 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
249 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  74.7 
 
 
249 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  66.8 
 
 
253 aa  306  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  46.12 
 
 
259 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  45.09 
 
 
257 aa  208  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  45.08 
 
 
254 aa  202  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  43.22 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  46.03 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  43.22 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 
252 aa  196  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  44.35 
 
 
272 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  44.35 
 
 
268 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 
241 aa  195  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  43.44 
 
 
254 aa  194  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  42.24 
 
 
249 aa  192  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  43.04 
 
 
279 aa  191  9e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  36.93 
 
 
241 aa  191  9e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  38.14 
 
 
253 aa  190  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  37.55 
 
 
250 aa  189  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  42.62 
 
 
244 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  45.73 
 
 
247 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  40 
 
 
245 aa  187  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  41.78 
 
 
325 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  38.68 
 
 
259 aa  185  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  36.82 
 
 
236 aa  185  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  38.75 
 
 
242 aa  185  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  40.52 
 
 
246 aa  185  7e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  38.59 
 
 
239 aa  185  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  37.34 
 
 
241 aa  184  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.91 
 
 
295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  41.35 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  41.35 
 
 
244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  41.35 
 
 
244 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  40.26 
 
 
247 aa  183  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  41.77 
 
 
244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  38.91 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  35.68 
 
 
237 aa  181  7e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.17 
 
 
256 aa  181  9.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  41.35 
 
 
244 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  40.83 
 
 
276 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 
301 aa  180  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 
241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 
241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.44 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.905308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  38.5 
 
 
241 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  38.5 
 
 
241 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  39.66 
 
 
244 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  40.43 
 
 
256 aa  179  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  41.77 
 
 
244 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 
241 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 
241 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  42.98 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 
241 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  41.18 
 
 
246 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  43.3 
 
 
247 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  40.51 
 
 
244 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  40.51 
 
 
244 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  40.51 
 
 
244 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  37.45 
 
 
258 aa  176  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  40.51 
 
 
244 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  41.18 
 
 
306 aa  176  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  38.05 
 
 
241 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 
244 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 
241 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  36.82 
 
 
240 aa  175  5e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  41.74 
 
 
255 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  39.24 
 
 
244 aa  175  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  40.51 
 
 
244 aa  174  8e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0114  ABC transporter related  39.73 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  39.66 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1806  ABC transporter related  44.44 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.802258  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.08 
 
 
321 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.32 
 
 
293 aa  172  5.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  41.04 
 
 
257 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  40.91 
 
 
253 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  39.32 
 
 
309 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.98 
 
 
320 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  40.53 
 
 
328 aa  169  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.56 
 
 
305 aa  169  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.64 
 
 
335 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  38.4 
 
 
261 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  41.6 
 
 
279 aa  169  5e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.67 
 
 
312 aa  168  6e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  37.39 
 
 
251 aa  168  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  39.66 
 
 
244 aa  168  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42 
 
 
380 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0867076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  40.65 
 
 
259 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  35.71 
 
 
258 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.36 
 
 
338 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.7 
 
 
312 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  33.62 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  34.04 
 
 
238 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  43.58 
 
 
301 aa  165  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  38.03 
 
 
327 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1502  ABC transporter related  41.88 
 
 
243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  39.26 
 
 
250 aa  165  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  41.63 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  33.19 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>