More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0070 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  100 
 
 
244 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  97.95 
 
 
244 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  97.95 
 
 
244 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  97.95 
 
 
244 aa  486  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  94.26 
 
 
244 aa  470  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  93.85 
 
 
244 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  94.26 
 
 
244 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  93.85 
 
 
244 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  93.85 
 
 
244 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  84.43 
 
 
244 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  84.02 
 
 
244 aa  425  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  83.2 
 
 
244 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  83.61 
 
 
244 aa  426  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  81.97 
 
 
244 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  81.56 
 
 
244 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  79.1 
 
 
244 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  58.17 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  52.02 
 
 
248 aa  274  8e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  55.24 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  53.63 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  55.24 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3800  sodium ABC transporter ATP-binding protein  52.21 
 
 
262 aa  228  7e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  hitchhiker  0.00685635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
251 aa  204  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  39.08 
 
 
241 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  38.17 
 
 
274 aa  185  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  39.92 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  41.78 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  35.84 
 
 
369 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  39.08 
 
 
243 aa  181  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1528  ABC transporter related  40.5 
 
 
246 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  42.99 
 
 
260 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  37.5 
 
 
240 aa  179  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  41.59 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  37.45 
 
 
247 aa  178  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  38.11 
 
 
257 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  34.98 
 
 
252 aa  178  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.51 
 
 
249 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  39.74 
 
 
273 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  41.53 
 
 
252 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  37.6 
 
 
259 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  39.83 
 
 
246 aa  175  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  36.04 
 
 
356 aa  175  7e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.73 
 
 
305 aa  174  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.66 
 
 
312 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  38.79 
 
 
311 aa  173  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  36.55 
 
 
245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.99 
 
 
305 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  36.6 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  41.52 
 
 
337 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  39.57 
 
 
331 aa  171  6.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  38.07 
 
 
318 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  35.68 
 
 
317 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  38.74 
 
 
319 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  36.2 
 
 
325 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  40.43 
 
 
344 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  34.57 
 
 
253 aa  169  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  34.41 
 
 
315 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  37.55 
 
 
259 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.27 
 
 
316 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2589  ATP-binding transport protein NatA  40.25 
 
 
266 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.408024  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  38.26 
 
 
328 aa  168  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  38.62 
 
 
257 aa  168  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  37.7 
 
 
240 aa  168  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  39.25 
 
 
306 aa  168  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  35.47 
 
 
293 aa  168  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  39.33 
 
 
250 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  34.18 
 
 
245 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  37.34 
 
 
255 aa  167  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  37.5 
 
 
295 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  40.35 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  39.01 
 
 
340 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  39.15 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  42.86 
 
 
299 aa  166  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.16 
 
 
318 aa  166  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  34.91 
 
 
296 aa  165  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  38.18 
 
 
305 aa  165  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 
312 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  37.5 
 
 
512 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  38.68 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  36.17 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  39.46 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  37.07 
 
 
320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  37.07 
 
 
320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.9 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  39.27 
 
 
373 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  35.87 
 
 
307 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  34.68 
 
 
338 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  36.24 
 
 
317 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  36.48 
 
 
578 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.82 
 
 
339 aa  162  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  33.6 
 
 
305 aa  162  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  39.91 
 
 
339 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  39.91 
 
 
339 aa  162  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  36.61 
 
 
308 aa  161  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.53 
 
 
321 aa  162  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.82 
 
 
309 aa  161  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  37.95 
 
 
303 aa  161  9e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.7 
 
 
318 aa  161  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  36.61 
 
 
337 aa  160  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0114  ABC transporter related  32.94 
 
 
258 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>