More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2329 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 301 aa  593  1e-168  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  45.39 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0987  ABC transporter-like protein  39.87 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.488285  normal  0.723293 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2275  ABC transporter related protein  40 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0699  ABC transporter related  39.94 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  37.01 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4939  ABC transporter related  43.14 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0242124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2612  ABC transporter related protein  45 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.472941 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1411  ABC-type transport system, ATPase component  39.68 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000715833  unclonable  3.14e-28 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.3 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0789  ABC transporter related  35.37 
 
 		 360 aa  186  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.45 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1335  ABC transporter related  37.97 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.434396  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  42.44 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  42.11 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  43.28 
 
 		 309 aa  179  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0292  ABC transporter related  35.63 
 
 		 320 aa  178  9e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.274701  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  38.46 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.59 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.19 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.54 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.7 
 
 		 309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.21 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  35.71 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  35.71 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.55 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  38.87 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.43 
 
 		 318 aa  169  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0872  ABC transporter related  43.54 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0610304 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  44 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 309 aa  169  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  37.3 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  42.86 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  41.05 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.66 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  43.81 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  39.32 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.21 
 
 		 324 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  40.26 
 
 		 323 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.58 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.58 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  35.71 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  35.48 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  42.04 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  34.65 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  39.23 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  39.02 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4655  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.83 
 
 		 449 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  32.79 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  35.14 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  35.06 
 
 		 304 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1263  ABC transporter related  42.92 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.600052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  40.71 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  41.78 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  38.1 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0763  ABC transporter related  39.13 
 
 		 296 aa  161  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0228  ABC transporter related  41.72 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00487637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  38.01 
 
 		 315 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.79 
 
 		 343 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  35.05 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  42.22 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.72 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0523  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000509478 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  36.77 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  36.77 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 312 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  36.96 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  36.45 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  37.88 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.5 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  35.2 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  36.77 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  33.66 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  34.74 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  34.74 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  31.76 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.67 
 
 		 324 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  34.74 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  35.06 
 
 		 351 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  38.27 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.79 
 
 		 330 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  35.06 
 
 		 351 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  35.24 
 
 		 321 aa  158  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  40.81 
 
 		 326 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.04 
 
 		 321 aa  158  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  33.87 
 
 		 312 aa  158  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  34.74 
 
 		 304 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  34.74 
 
 		 304 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  34.74 
 
 		 304 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  33.78 
 
 		 316 aa  158  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>