More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1419 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  483  1e-135  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  55.13 
 
 
252 aa  246  3e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  45.68 
 
 
250 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  41.25 
 
 
253 aa  211  7e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  42.04 
 
 
259 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  39.83 
 
 
257 aa  204  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 
252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  41.98 
 
 
237 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  38.49 
 
 
250 aa  186  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  38.49 
 
 
250 aa  186  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  38.33 
 
 
245 aa  185  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  41.03 
 
 
259 aa  181  6e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  37.6 
 
 
239 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1021  ABC transporter related  39.67 
 
 
237 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00128788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 
249 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  36.75 
 
 
246 aa  178  7e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  40.59 
 
 
249 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0089  ABC transporter related  38.84 
 
 
237 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  40.16 
 
 
276 aa  176  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  34.75 
 
 
249 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  40.91 
 
 
256 aa  175  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
259 aa  175  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  40.59 
 
 
253 aa  174  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  39.33 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  41.1 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.64 
 
 
312 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  35.42 
 
 
236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  38.91 
 
 
272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  42.49 
 
 
270 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  39.24 
 
 
279 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  40.08 
 
 
247 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  37.5 
 
 
272 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  37.92 
 
 
268 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  37.82 
 
 
301 aa  169  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  39 
 
 
236 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 
303 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  34.57 
 
 
244 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0737  ABC transporter related  38.82 
 
 
238 aa  168  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0135458 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  39.24 
 
 
247 aa  168  6e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
241 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  35.17 
 
 
256 aa  168  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  40.18 
 
 
314 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  40.83 
 
 
254 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5208  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
259 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  37.39 
 
 
306 aa  167  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
241 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
241 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 
241 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  42.01 
 
 
339 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0385  ABC transporter related  40.25 
 
 
248 aa  166  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  35 
 
 
241 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  32.92 
 
 
237 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  35 
 
 
241 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  34.31 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 
241 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 
241 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  37.67 
 
 
287 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  33.91 
 
 
247 aa  166  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  37.45 
 
 
287 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  37.22 
 
 
308 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  34.58 
 
 
241 aa  164  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  37.24 
 
 
247 aa  165  8e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.87 
 
 
256 aa  165  8e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  36.51 
 
 
414 aa  164  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  36.16 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  40.18 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0409  ABC transporter related protein  37.39 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  39.55 
 
 
292 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  39.08 
 
 
253 aa  163  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  32.92 
 
 
240 aa  162  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  39.56 
 
 
258 aa  162  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  36.6 
 
 
238 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  38.82 
 
 
261 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  36.6 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 
238 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  38.79 
 
 
288 aa  162  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  39.73 
 
 
339 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  34.57 
 
 
242 aa  161  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  39.73 
 
 
339 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 
243 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  40.42 
 
 
257 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 
241 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  40.71 
 
 
304 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  36.07 
 
 
309 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  36.56 
 
 
310 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  40.18 
 
 
339 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  41.28 
 
 
341 aa  160  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1233  ABC transporter related  38.53 
 
 
236 aa  160  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.954644  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1289  ABC transporter related  34.84 
 
 
242 aa  159  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.077287  hitchhiker  0.00948798 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  34.72 
 
 
308 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  40 
 
 
254 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  40.51 
 
 
255 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  39.32 
 
 
261 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  37.27 
 
 
303 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  40.64 
 
 
339 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  41.18 
 
 
305 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 
255 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.84 
 
 
295 aa  158  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  34.76 
 
 
266 aa  158  7e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>