More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1115 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 292 aa  578  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  71.09 
 
 		 293 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  61.3 
 
 		 290 aa  358  6e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  61.9 
 
 		 406 aa  349  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  63.39 
 
 		 307 aa  348  5e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  60.07 
 
 		 341 aa  329  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  59.52 
 
 		 326 aa  327  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  59.04 
 
 		 292 aa  324  9e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  58.05 
 
 		 305 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  56.95 
 
 		 326 aa  317  1e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  59.18 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  55.48 
 
 		 318 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  54.08 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  55.25 
 
 		 293 aa  295  7e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  54.61 
 
 		 298 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  55.29 
 
 		 297 aa  286  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  53.98 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  54.61 
 
 		 294 aa  281  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  52.22 
 
 		 303 aa  276  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  54.27 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  51.69 
 
 		 295 aa  267  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 309 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.54 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.69 
 
 		 297 aa  208  8e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  35.62 
 
 		 299 aa  208  9e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  35.62 
 
 		 299 aa  208  9e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  37.2 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  38.14 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  36.18 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  37.93 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  38.83 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  37.59 
 
 		 303 aa  202  6e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  37.59 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 		 319 aa  202  8e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  37.59 
 
 		 294 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.48 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 		 294 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  37.46 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 		 303 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  37.24 
 
 		 294 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  34.93 
 
 		 298 aa  195  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  36.18 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  36.11 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  34.01 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  37.82 
 
 		 321 aa  191  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  34.03 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  32.99 
 
 		 298 aa  188  9e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  36.18 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 		 296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  33.44 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  31.94 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  37.63 
 
 		 294 aa  182  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  42.61 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  34.46 
 
 		 300 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  42.47 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  37.07 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  40.53 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  41.4 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  34.01 
 
 		 304 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  32.03 
 
 		 309 aa  175  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.46 
 
 		 312 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  38.25 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  36.15 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.16 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  33.11 
 
 		 305 aa  171  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  32.53 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  35.02 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  34.31 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.83 
 
 		 321 aa  170  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  33.99 
 
 		 314 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  40.54 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  35.2 
 
 		 328 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  31.91 
 
 		 312 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  38.22 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  39.61 
 
 		 296 aa  165  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  41.36 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  36.2 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  35.33 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  31.25 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  36.21 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  41.67 
 
 		 912 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  37.05 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  39.55 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  42.45 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  44.64 
 
 		 911 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 		 259 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.1 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  35.93 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 253 aa  161  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  33.56 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  30.24 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  36.48 
 
 		 252 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>