More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3287 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  100 
 
 
261 aa  519  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  81.38 
 
 
272 aa  388  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  64.66 
 
 
279 aa  318  5e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  63.52 
 
 
259 aa  311  6.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  63.27 
 
 
253 aa  306  1.0000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  62.08 
 
 
250 aa  296  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  62.95 
 
 
270 aa  286  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  61.16 
 
 
266 aa  280  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  57.32 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  45.97 
 
 
250 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  43.28 
 
 
257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  44.12 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  40 
 
 
247 aa  206  5e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  44.02 
 
 
309 aa  203  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 
245 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  42.58 
 
 
309 aa  198  7e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  41.06 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  41.06 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  43.7 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  44.98 
 
 
309 aa  195  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 
259 aa  195  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  43.53 
 
 
314 aa  194  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  43.16 
 
 
309 aa  194  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  47.51 
 
 
314 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  44.64 
 
 
327 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  40.34 
 
 
249 aa  192  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  44.92 
 
 
318 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  44.92 
 
 
318 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  42.42 
 
 
360 aa  190  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  40.38 
 
 
326 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  41.78 
 
 
313 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  42.22 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  38.84 
 
 
242 aa  189  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  39.37 
 
 
249 aa  189  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  44.95 
 
 
302 aa  188  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  41.33 
 
 
313 aa  187  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  40.41 
 
 
243 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  42.02 
 
 
337 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  42.44 
 
 
912 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  36.97 
 
 
246 aa  187  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  42.73 
 
 
325 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.79 
 
 
333 aa  186  3e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  38.49 
 
 
241 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  40.57 
 
 
512 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  44.07 
 
 
318 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  44.14 
 
 
310 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  39.72 
 
 
299 aa  185  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  39.18 
 
 
243 aa  185  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 
244 aa  185  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  44.89 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  40.82 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  42.26 
 
 
356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  42.74 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  40.83 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  38.08 
 
 
241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  39.15 
 
 
320 aa  183  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  38.91 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  38.49 
 
 
241 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  39.68 
 
 
251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  42.97 
 
 
308 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 
312 aa  183  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 
241 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 
241 aa  182  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  40.99 
 
 
319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  44.05 
 
 
316 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  41.86 
 
 
319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  38.49 
 
 
241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 
241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  38.49 
 
 
241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  41.13 
 
 
328 aa  182  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  44.2 
 
 
339 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  43.24 
 
 
303 aa  181  7e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 
241 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  42.27 
 
 
299 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  38.08 
 
 
241 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  39.2 
 
 
252 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4353  ABC transporter related  45.05 
 
 
340 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0121046  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  40 
 
 
335 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  38.91 
 
 
230 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  38.17 
 
 
274 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  41.6 
 
 
316 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  45.91 
 
 
334 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  40.68 
 
 
259 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.48 
 
 
316 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  42.56 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  41.99 
 
 
344 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  41.35 
 
 
912 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  39.5 
 
 
333 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  40.27 
 
 
309 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  43.58 
 
 
304 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  37.4 
 
 
510 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  40.87 
 
 
315 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 
317 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  40.86 
 
 
911 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  45.58 
 
 
332 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  34.98 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  40.17 
 
 
275 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>