More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2644 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  100 
 
 
334 aa  644    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  62.22 
 
 
310 aa  381  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  63.67 
 
 
309 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  61.22 
 
 
303 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  59.94 
 
 
305 aa  352  4e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  58.47 
 
 
310 aa  348  6e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  58.41 
 
 
310 aa  345  5e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2631  ABC transporter related  57.83 
 
 
301 aa  335  5e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  53.67 
 
 
304 aa  330  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  58.52 
 
 
318 aa  327  3e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0074  ABC transporter related protein  55.73 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  50.47 
 
 
335 aa  307  1.0000000000000001e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  55.77 
 
 
323 aa  306  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  53.46 
 
 
316 aa  300  2e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  50.15 
 
 
346 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  51.3 
 
 
310 aa  295  6e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  49.19 
 
 
309 aa  288  7e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  48.9 
 
 
305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3716  ABC transporter related protein  55.14 
 
 
311 aa  285  5.999999999999999e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  49.51 
 
 
308 aa  285  5.999999999999999e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  51.11 
 
 
332 aa  279  5e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
373 aa  271  8.000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  59.91 
 
 
249 aa  265  8e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  45.71 
 
 
316 aa  255  6e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  38.44 
 
 
356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.1 
 
 
309 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  40.65 
 
 
311 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  38.26 
 
 
303 aa  202  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  37.58 
 
 
316 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  38.59 
 
 
302 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  41.26 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  46.43 
 
 
304 aa  196  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  39.74 
 
 
303 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  37.03 
 
 
313 aa  192  6e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  41.53 
 
 
259 aa  192  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  38.81 
 
 
316 aa  192  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  36.71 
 
 
313 aa  192  9e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  34.6 
 
 
318 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  40.5 
 
 
304 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.22 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  36.39 
 
 
313 aa  189  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  39.1 
 
 
308 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  34.81 
 
 
318 aa  189  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  37.86 
 
 
304 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  34.78 
 
 
340 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  45.35 
 
 
279 aa  187  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  44.98 
 
 
288 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 
310 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  34.08 
 
 
307 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  37.38 
 
 
300 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  38.97 
 
 
390 aa  185  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  37.94 
 
 
338 aa  185  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  38.41 
 
 
307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  34.09 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  35.35 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  46.12 
 
 
292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  41.1 
 
 
246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  32 
 
 
319 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
301 aa  182  6e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  33.44 
 
 
300 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  41.16 
 
 
326 aa  182  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  40.99 
 
 
250 aa  182  6e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  38.71 
 
 
301 aa  182  6e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  40.99 
 
 
250 aa  182  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  38.26 
 
 
301 aa  182  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  36.45 
 
 
313 aa  182  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.23 
 
 
360 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  44.64 
 
 
250 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  30.91 
 
 
312 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  35.03 
 
 
327 aa  181  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.81 
 
 
368 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  39.82 
 
 
243 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  43.53 
 
 
250 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  33.66 
 
 
293 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  33.97 
 
 
300 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  38.92 
 
 
457 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  39.51 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  33.33 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  36.11 
 
 
306 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.31 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  33.97 
 
 
299 aa  180  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  32.28 
 
 
311 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  33.01 
 
 
293 aa  180  4e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  36.98 
 
 
310 aa  179  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  36.98 
 
 
310 aa  179  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  30.7 
 
 
312 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  35.37 
 
 
298 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  37.83 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  47.89 
 
 
253 aa  179  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.18 
 
 
318 aa  179  7e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  36.62 
 
 
347 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  39.25 
 
 
302 aa  179  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.54 
 
 
329 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.38 
 
 
312 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  36.6 
 
 
318 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  31.55 
 
 
321 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  30.38 
 
 
312 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  32.8 
 
 
302 aa  178  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.38 
 
 
312 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  30.06 
 
 
312 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>